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杧果细菌性角斑病菌phd基因克隆与序列分析
引用本文:杨 倩,詹儒林,柳 凤,何忠勤.杧果细菌性角斑病菌phd基因克隆与序列分析[J].中国果业信息,2019,48(2).
作者姓名:杨 倩  詹儒林  柳 凤  何忠勤
作者单位:海南大学热带农林学院,中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,中国热带农业科学院南亚热带作物研究所
基金项目:国家重点研发计划子课题晚熟芒果农药减施增效技术集成(2017YFD0202107-6);广东省现代农业产业技术体系创新团队优稀水果产业技术体系首席专家(2016LM144)。
摘    要:由柑橘黄单胞菌杧果致病变种(Xanthomonas citri pv.mangiferaeindicae, Xcm)引起的杧果细菌性角斑病是杧果上的一种重要细菌性病害,严重危害杧果产业发展。为了研究抗毒素phd基因的结构和功能,本试验通过在NCBI上选取已被注释的Xcm抗毒素phd基因的序列,设计出引物phd-F和phd-R,从Xcm003菌株中扩增出258 bp的DNA片段,提交至NCBI的登录号是MH401645。经序列分析该片段是一个完整的phd基因,编码85个氨基酸,其理论分子量9.68 kD,理论等电点为9.39,是一种亲水性蛋白,无信号肽,有6个磷酸化位点以及一个结构域。系统进化树结果显示,该基因的氨基酸序列与Xanthomonas citri pv.mangiferaeindicae LMG941的Phd蛋白聚为一类。通过克隆杧果细菌性角斑病菌phd基因并对其进行生物信息学分析,为深入研究phd基因做基础。

关 键 词:柑橘黄单胞杧果致病型    phd    克隆    序列分析
收稿时间:2018/12/3 0:00:00
修稿时间:2018/12/20 0:00:00
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