| 中国李品种‘秋姬’基因组Survey测序分析 |
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| 引用本文： | 黄振宇,申飞,夏乐晗,陈龙,陈玉玲.中国李品种‘秋姬’基因组Survey测序分析[J].中国果业信息,2020,49(3). |
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| 作者姓名： | 黄振宇 申飞 夏乐晗 陈龙 陈玉玲 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院郑州果树研究所,北京市生物技术研究中心，北京市农林科学院,中国农业科学院郑州果树研究所,中国农业科学院郑州果树研究所,中国农业科学院郑州果树研究所 |
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| 基金项目： | 中国农业科学院科技创新工程专项经费项目(CAAS-ASTIP-2019-ZFRI)；中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610192019206) |
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| 摘 要： | 中国李是重要的落叶果树之一,具有较高的经济价值与生态价值,但其全基因组信息尚未被解析,限制着相关研究的深入开展。本研究通过二代基因组Survey测序分析,对中国李品种‘秋姬’全基因组信息进行初步解析,质控后共获得22.9 Gb 高质量数据,经17-mer分析,预估其基因组大小为305.6 Mb,基因组杂合度为0.92%,属于高杂合中型基因组；采用SOAPdenovo软件进行组装,所得Contig N50为440 bp,Scaffold总长约为267 Mb,后续拟用第三代测序技术进行精细组装。
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| 关 键 词： | 李 基因组 测序 |
| 收稿时间： | 2019/10/16 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/10/16 0:00:00 |
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