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施马伦贝格病焦磷酸测序检测方法的建立
引用本文:王彩霞,林祥梅,张永宁,吕继洲,冯春燕,袁向芬,邓俊花,吴绍强.施马伦贝格病焦磷酸测序检测方法的建立[J].中国动物检疫,2014,31(10):57-61.
作者姓名:王彩霞  林祥梅  张永宁  吕继洲  冯春燕  袁向芬  邓俊花  吴绍强
摘    要:为适应口岸施马伦贝格病快速、准确、高通量检测需求,建立一种基于RT-PCR及焦磷酸测序技术平台的施马伦贝格病检测方法。本研究针对施马伦贝格病毒基因组RNA的S、M和L三个基因节段保守区域利用焦磷酸测序软件PyroMark Q96ID分别设计RT-PCR扩增引物及焦磷酸测序引物,以人工合成的SBV重组质粒为模板分别建立了SBV S、M、L基因的PCR-焦磷酸测序检测方法,比较三基因的PCR扩增结果以及测序分析结果,结合特异性检测结果,最终确定以M基因作为靶基因建立的焦磷酸测序检测方法效果最好,并以德国FLI提供的SBV(BH80株)RNA对所建立的方法进行验证,通过对测得序列的比对分析可确定为施马伦贝格病毒,这表明本研究所建立的方法灵敏度高、稳定性好、特异性强,可以用于施马伦贝格病毒基因序列水平上的精准检测鉴定。

关 键 词:施马伦贝格病毒  聚合酶链反应  焦磷酸测序  鉴定  检测

Development of PCR-Pyrosequencing Assay for Detection of Schmallenberg Disease
Wang Caixi,Lin Xiangmei,Zhang Yongning,Lv Jizhou,Feng Chunyan,Yuan Xiangfen,Deng Junhu,Wu Shaoqiang.Development of PCR-Pyrosequencing Assay for Detection of Schmallenberg Disease[J].China Journal Of Animal Quarantine,2014,31(10):57-61.
Authors:Wang Caixi  Lin Xiangmei  Zhang Yongning  Lv Jizhou  Feng Chunyan  Yuan Xiangfen  Deng Junhu  Wu Shaoqiang
Abstract:
Keywords:
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