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| 我国鸭肝炎病毒分离株基因组的测定与分析 | |
| 引用本文： | 马秀丽,宋敏训,于可响,廖明,辛朝安.我国鸭肝炎病毒分离株基因组的测定与分析[J].华南农业大学学报,2009,30(1). |
| 作者姓名： | 马秀丽 宋敏训 于可响 廖明 辛朝安 |
| 作者单位： | 1. 农业部养禽与禽病防治重点开放实验室,华南农业大学,兽医学院,广东,广州,510642;山东省农业科学院,家禽研究所,山东,济南,250023 2. 山东省农业科学院,家禽研究所,山东,济南,250023 3. 农业部养禽与禽病防治重点开放实验室,华南农业大学,兽医学院,广东,广州,510642 |
| 基金项目： | 广东省科技计划，广东省农业厅动物防疫专项经费资助项目，山东省自然科学基金 |
| 摘 要： | 对我国鸭病毒性肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)分离株YZ和CL的全基因组进行了序列测定分析.结果表明,2分离株的基因组全长分别为7 713 nt和7 709 nt,包括626 nt的5′UTR、6 747 nt的ORF、314 nt的3′UTR以及23 nt和19 nt的poly(A)尾.结构蛋白VP0含有保守的四肽CPRP,VP3的N端存在一段约20个氨基酸的碱性氨基酸富集区域;VP1缺少RGD(Arg-Gly-Asp)基序.DHV2分离株存在3个不相关的2A蛋白基序,其中2A1蛋白类似口蹄疫病毒属的2A蛋白,2A2蛋白与AIG1蛋白(拟南芥)和GTPase更为相似,2A3蛋白则与副肠孤病毒属的2A2蛋白类型相似;2C蛋白含有保守基序EPxxxxxxGxxGxGK(S/T)、QxxxxxDDxxQ和KGxxxxSxxxxxS/T.3C蛋白含有催化三联体H38-D69-C144;3D蛋白包含KDELR、DxxxxD、GxxSGxxxTxxxNx、YGDD和FLKR等RNA聚合酶的特征基序.基于多聚蛋白、VP1、2C和3C蛋白的进化关系分析结果均表明,DHV分离株与副肠孤病毒属的遗传关系最近,但占据一个清晰的独立遗传谱系,应将DHV单独划属. |
| 关 键 词： | 鸭病毒性肝炎病毒(DHV) 分离株 基因组测序 基因组分析 |
Sequencing and Analysis of the Genome of Duck Hepatitis Virus Isolated from China |
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| MA Xiu-li,SONG Min-xun,YU Ke-xiang,LIAO Ming,XIN Chao-an.Sequencing and Analysis of the Genome of Duck Hepatitis Virus Isolated from China[J].Journal of South China Agricultural University,2009,30(1). | |
| Authors: | MA Xiu-li SONG Min-xun YU Ke-xiang LIAO Ming XIN Chao-an |
| Abstract: | |
| Keywords: | duck hepatitis virus isolates genome sequencing genome analysis |
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