青稞B组醇溶蛋白基因5′上游调控区的TAIL-PCR克隆及序列分析 |
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引用本文: | 韩兆雪,吴芳,赵桃,杨凡,钱刚,余懋群.青稞B组醇溶蛋白基因5′上游调控区的TAIL-PCR克隆及序列分析[J].麦类作物学报,2007,27(4):613-618. |
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作者姓名: | 韩兆雪 吴芳 赵桃 杨凡 钱刚 余懋群 |
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作者单位: | [1]中国科学院成都生物研究所,四川成都610041 [2]中国科学院研究生院,北京100039 |
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基金项目: | 科技部基础性工作专项(2006FY110700)资助项目;国家科技支撑计划农作物种质资源项目;中国科学院知识创新计划项目(KSCX2-SW-304). |
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摘 要: | 为了阐明青稞种子中B组醇溶蛋白合成的遗传调控机制,为分子改良大麦和小麦籽粒品质奠定基础,以青稞品种Z09和Z26的基因组DNA为模板,根据已克隆的青稞B组醇溶蛋白(B-hordein)基因的5’端序列设计三个基因特异的反向引物,分别与随机简并引物配对,进行热不对称嵌套PCR(Thermal asymmetric interlaeed PCR,TAIL-PCR)扩增,从两份西藏青稞材料中分离克隆出2个B-hordein基因的上游调控序列。序列测定结果表明,两个扩增片段长度分别为395和396bp,加上已知B-hordein基因中的GSP2引物序列与翻译起始密码子之间198bp的长度,则可得到约600bp的B-hordein基因5’上游调控序列。将所得序列与Genbank中的三个贮藏蛋白基因的对应区段进行序列比对,所得序列与来自野生智利大麦(H.chil-ense)的B3-hordein基因(Genbank登录号:AY998010)、普通小麦(T.aestivum)的低分子量麦谷蛋白亚基基因(Genbank登录号:X07747)和栽培大麦(H.vulgare)的B-hordein基因(Genbank登录号:X03103)具有81%~95%的序列相似性。推测其TATAbox位于-80bp,CAAT-likebox位于-140bp处。另外,在-300bp处存在一个胚乳盒(EndospermBox,EB),包含EM基序和GCN4基序。EM基序高度保守,GCN4基序有一个核苷酸位点的突变。此外,在约-560bp处存在一个胚乳盒类似结构。
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关 键 词: | 青稞 B-hordein基因 上游调控序列 TAIL-PCR 序列分析 |
文章编号: | 1009-1041(2007)04-0613-06 |
收稿时间: | 2007-03-20 |
修稿时间: | 2007-03-202007-05-10 |
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