| 11条白桦BpSPL家族基因的生物信息学和表达分析 |
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| 引用本文： | 宁坤,杨洋,马述山,李慧玉.11条白桦BpSPL家族基因的生物信息学和表达分析[J].林业科学研究,2016,29(5):646-653. |
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| 作者姓名： | 宁坤 杨洋 马述山 李慧玉 |
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| 作者单位： | 林木遗传育种国家重点实验室 东北林业大学, 黑龙江 哈尔滨 150040;林木遗传育种国家重点实验室 东北林业大学, 黑龙江 哈尔滨 150040;林木遗传育种国家重点实验室 东北林业大学, 黑龙江 哈尔滨 150040;林木遗传育种国家重点实验室 东北林业大学, 黑龙江 哈尔滨 150040 |
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| 基金项目： | “十二五”农村领域国家科技计划课题——“水曲柳和白桦珍贵用材林定向培育技术研究与示范”（2012BAD21B02）。 |
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| 摘 要： | 目的]研究白桦中SPL转录因子的基因序列特征及其在不同时期不同组织中的表达规律。方法]依据白桦45个转录组测序结果,共获得12条全长SPL基因,依次命名为白桦BpSPL1-BpSPL12,对其中11条BpSPL进行了生物信息学及基因表达特征分析。结果]生物信息学分析发现,11条BpSPL均含有1个高度保守的SBP结构域,且基因长度差异较大,含有2 10个不等数目的外显子,系统进化分析发现11条白桦SPL分属于六大类SPL蛋白;qRT-PCR分析结果显示,白桦BpSPL基因在不同时期的叶、顶芽、茎、雄花序中表达变化显著,多数SPL基因在顶芽中7月5日和8月20日至9月20日时期表达较高,除BpSPL1基因外在雄花序从6月份到9月份的生长阶段中,SPL的表达水平呈现逐渐升高的总体趋势。结论]BpSPL基因可能参与到了白桦顶芽和雄花序的生长发育过程。
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| 关 键 词： | 白桦 BpSPL基因家族 生物信息学 基因表达 |
| 收稿时间： | 2015/8/26 0:00:00 |
Bioinformatics and Expression Analysis of 11 BpSPLs in Betula platyphylla Suk. |
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| NING Kun,YANG Yang,MA Shu-shan and LI Hui-yu.Bioinformatics and Expression Analysis of 11 BpSPLs in Betula platyphylla Suk.[J].Forest Research,2016,29(5):646-653. |
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| Authors: | NING Kun YANG Yang MA Shu-shan and LI Hui-yu |
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| Institution: | Key Laboratory of Tree Genetic Improvement and Biotechnology, Northeast Forestry University, Harbin 150040, Heilongjiang, China;Key Laboratory of Tree Genetic Improvement and Biotechnology, Northeast Forestry University, Harbin 150040, Heilongjiang, China;Key Laboratory of Tree Genetic Improvement and Biotechnology, Northeast Forestry University, Harbin 150040, Heilongjiang, China;Key Laboratory of Tree Genetic Improvement and Biotechnology, Northeast Forestry University, Harbin 150040, Heilongjiang, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Betula platyphylla Suk BpSPL gene family bioinformatics gene expression |
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