| 毛皮动物肺炎克雷伯菌Ⅲ型菌毛A基因克隆测序与生物信息分析 |
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| 引用本文： | 钟世勋,迟珊珊,王振,姜晓东,刘丽萍,邵明旭,王传文,于翠莲,朱瑞良.毛皮动物肺炎克雷伯菌Ⅲ型菌毛A基因克隆测序与生物信息分析[J].中国兽医学报,2015(1):74-80. |
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| 作者姓名： | 钟世勋 迟珊珊 王振 姜晓东 刘丽萍 邵明旭 王传文 于翠莲 朱瑞良 |
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| 作者单位： | 山东农业大学动物科技学院/山东省动物生物技术与疫病防治重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30972183,31272595) |
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| 摘 要： | 根据GenBank中肺炎克雷伯菌Ⅲ型菌毛结构基因A(MrkA)JF759921的序列设计1对引物,对8株毛皮动物肺炎克雷伯菌进行克隆测序,并应用生物信息学相关软件和方法,预测MrkA蛋白二级结构和B细胞抗原表位。PCR扩增出了609bp的目的基因片段,生物信息分析结果显示其开放阅读框架为609bp,编码202个氨基酸;二级结构以无规卷曲为主,有少量的α-螺旋和β-片层,少见β-转角,推测MrkA蛋白有8个B细胞优势抗原表位区域。结果表明,MrkA基因较稳定,其在进化过程中并未发生明显变异,为进一步分析肺炎克雷伯菌免疫机理、制备单克隆抗体和设计表位疫苗等奠定理论基础。
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| 关 键 词： | 肺炎克雷伯菌 MrkA基因 二级结构 B细胞抗原表位预测 |
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