| 利用基因芯片分析比较Giza75和SG747纤维发育差异表达基因 |
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| 引用本文： | 宋吉坤,辛玥,李龙云,刘国元,裴文锋,马建江,曲延英,于霁雯,吴嫚.利用基因芯片分析比较Giza75和SG747纤维发育差异表达基因[J].新疆农业科学,2022,59(6):1312-1330. |
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| 作者姓名： | 宋吉坤 辛玥 李龙云 刘国元 裴文锋 马建江 曲延英 于霁雯 吴嫚 |
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| 作者单位： | 1.中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室,河南安阳 4550002.新疆农业大学农学院/教育部棉花工程研究中心,乌鲁木齐 830052 |
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| 基金项目： | 新疆维吾尔自治区自然科学基金(2020D01A135);新疆维吾尔自治区自然科学基金(2021D0113113);中国农业科学院科技创新工程;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610162021043) |
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| 摘 要： | 【目的】 利用适应性广、产量高的陆地棉和纤维品质优异的海岛棉进行高通量基因芯片比较分析,筛选和鉴定棉纤维发育相关的关键基因。【方法】 以SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium barbadense L.)为材料,利用Affymetrix公司的棉花寡聚核苷酸基因芯片对其开花后10 d(10 days after anthesis, 10 DPA)的棉纤维进行表达谱分析。【结果】 材料Giza75和SG747共筛选到3 905个差异表达基因,其中功能预测基因占比17.80%,翻译、核糖体结构相关基因占比16.82%,翻译后修饰占比14.32%。Gra.2198.1.A1_at正向调控棉纤维发育过程,Gra.85.1.S1_at、Ghi.249.1.A1_at和Ghi.8448.1.S1_x_at负向调控棉纤维发育过程,可能参与了棉纤维发育过程。【结论】 利用陆地棉和海岛棉基因芯片并结合qRT-PCR筛选和鉴定到4个纤维发育相关的关键候选基因。
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| 关 键 词： | 海岛棉 陆地棉 棉纤维品质 基因芯片 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2021-09-26 |
Comparative Analysis of Gene Expression between Giza 75 and SG 747 Using Cotton Oligonucleotide Microarrays during Fiber Development |
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| SONG Jikun,XIN Yue,LI Longyun,LIU Guoyuan,PEI Wenfeng,MA Jianjiang,QU Yanying,YU Jiwen,WU Man.Comparative Analysis of Gene Expression between Giza 75 and SG 747 Using Cotton Oligonucleotide Microarrays during Fiber Development[J].Xinjiang Agricultural Sciences,2022,59(6):1312-1330. |
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| Authors: | SONG Jikun XIN Yue LI Longyun LIU Guoyuan PEI Wenfeng MA Jianjiang QU Yanying YU Jiwen WU Man |
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| Institution: | 1. Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences/State Key Laboratory of Cotton Biology/Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Anyang Henan 455000 China2. Research Centre of Cotton Engineering, Ministry of Education and Rural Affairs / College of Agronomy, Xinjiang Agricultural University, Urumqi, 830052 China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Gossypium barbadense Gossypium hirsutum fiber quality affymetrix microarray differentially expressed genes |
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