| 栽培金鸡菊EST-SSR分子标记开发与亲缘关系分析 |
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| 引用本文： | 孙浩男,李蓉,李明阳,郑妍,刘志杰,张存石,刘冬云,李鹤.栽培金鸡菊EST-SSR分子标记开发与亲缘关系分析[J].草地学报,2022,30(6):1430-1440. |
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| 作者姓名： | 孙浩男 李蓉 李明阳 郑妍 刘志杰 张存石 刘冬云 李鹤 |
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| 作者单位： | 河北农业大学园林与旅游学院, 河北 保定 071000 |
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| 基金项目： | 河北省重点研发计划项目（20326339D）；现代种业科技创新专项（21326348D）资助 |
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| 摘 要： | 为了开发适用于栽培金鸡菊的EST-SSR分子标记，采用二代高通量测序技术对剑叶金鸡菊‘斯丹泰勒’（Coreopsis lanceolata ‘Sterntaler’）的叶片进行转录组测序。结果表明：通过转录组测序共得到42 958条Unigene，利用MISA软件共检测出个6 546个SSR位点，平均分布距离6.36 kb。除单核苷酸外，重复类型以二核苷酸和三核苷酸为主，分别占总数的19.28%和30.13%，二者优势重复单元和占比分别为AG/CT （57.30%）和AAT/ATT （27.94%）。通过Primer3软件设计得到4 499条引物，在随机筛选的50对引物中成功开发出22对多态性较好的引物，扩增出的166个条带全部具有多态性。通过UPGMA聚类分析，在遗传距离为0.460时可将100个栽培金鸡菊种质划分为7类，其遗传相似系数介于0.542 2~1之间，平均为0.747 6。金鸡菊组、两色组、歧序组和轮叶组相关的种质可作为金鸡菊远缘杂交育种的材料。本研究为栽培金鸡菊的分类鉴定、杂交育种和绘制指纹图谱提供了理论依据。
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| 关 键 词： | 金鸡菊 种质资源 EST-SSR 转录组 亲缘关系 |
| 收稿时间： | 2021-11-09 |
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