| 猪TLR4基因SNP位点筛选及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王馨敏,朱乔峰,马越,秦雅晶,李之昂,刘丽霞.猪TLR4基因SNP位点筛选及生物信息学分析[J].甘肃畜牧兽医,2020(3):61-64,73. |
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| 作者姓名： | 王馨敏 朱乔峰 马越 秦雅晶 李之昂 刘丽霞 |
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| 作者单位： | 西北民族大学生命科学与工程学院 |
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| 基金项目： | 西北民族大学中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(31920190025);西北民族大学2019年本科生科研创新项目(XBMU-BYL19124). |
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| 摘 要： | 通过构建基因组DNA混合池对猪TLR4基因进行扩增和测序,并对其编码区的SNP位点进行筛选,运用生物信息学分析软件对猪TLR4基因的理化特性和编码蛋白质的二、三级结构进行预测。结果发现,在扩增的TLR4基因上没有发现SNP位点,猪TLR4基因片段一共编码118个氨基酸,其中缬氨酸(Val)最多,甲硫氨酸(Met)最少,编码产物不稳定指数大于40,说明编码产物具有不稳定性。编码蛋白质片段的亲水性平均值为0.385,说明该基因编码的蛋白质呈现疏水性,猪TLR4基因编码的蛋白质是一种不溶性蛋白质。研究结果为猪TLR4基因深入研究提供理论基础。
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| 关 键 词： | TLR4 猪 SNP位点 蛋白质 氨基酸 |
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