福氏2a志贺菌DNA转录激活蛋白MarA的二级结构及其B细胞抗原表位预测 |
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引用本文: | 魏小娟,张继瑜,王松泰,李剑勇,周旭正,牛建荣,李金善.福氏2a志贺菌DNA转录激活蛋白MarA的二级结构及其B细胞抗原表位预测[J].黑龙江畜牧兽医,2009(11). |
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作者姓名: | 魏小娟 张继瑜 王松泰 李剑勇 周旭正 牛建荣 李金善 |
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作者单位: | 中国农业科学院,兰州畜牧与兽药研究所中国农业科学院新兽药重点开放实验室,甘肃,兰州,730050 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目 |
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摘 要: | 研究以福氏2a志贺菌(Shigella flexneri 2a,s.f 2a)的基因组序列为材料,采用Gamier-Robson法、Chou-Fasman法和Kamplus-Schulz法预测了其DNA结合转录激活蛋白MarA的二级结构,用Kyte-Doolittle法对结构蛋白的亲水性进行了分析,用Emini法预测了蛋白的表面可能性,以Jameson-Wolf法预测了蛋白的抗原指数,然后综合评价了福氏2a志贺菌转录激活蛋白MarA的B细胞抗原表位.结果表明:福氏2a志贺菌MarA蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的转角和无规则卷曲等柔性区域以及α-螺旋和β-折叠区段,该蛋白有多处抗原指数较高的区段,其中含有潜在的B细胞优势抗原表位,因此其在免疫学中的地位也应当引起重视.
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关 键 词: | 福氏2a志贺菌 DNA结合转录激活蛋白MarA 二级结构 B细胞表位 |
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