水貂ASIP基因单倍型检测及其皮肤组织mRNA差异表达分析 |
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引用本文: | 宋兴超,刘琳玲,王淑明,宋姗姗,徐超,杨童奥,刘宗岳,丛波,张志明,杨福合,彭英华.水貂ASIP基因单倍型检测及其皮肤组织mRNA差异表达分析[J].中国畜牧兽医,2019(10). |
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作者姓名: | 宋兴超 刘琳玲 王淑明 宋姗姗 徐超 杨童奥 刘宗岳 丛波 张志明 杨福合 彭英华 |
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作者单位: | 中国农业科学院特产研究所农业农村部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室;大连名威貂业有限公司 |
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摘 要: | 试验旨在探究鼠灰色(agouti signaling protein,ASIP)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)形成的单倍型及皮肤组织差异表达mRNA对水貂被毛色素沉积的影响。通过PCR扩增、Sanger测序技术对金州黑水貂、红眼白水貂和名威银蓝水貂ASIP基因进行SNPs单倍型检测分析,利用实时荧光定量PCR技术检测3种毛色皮肤组织ASIP基因的表达量,分析单倍型及mRNA差异表达与毛色表型的相关性。结果表明,301个样本中共检测到10个SNPs,内含子2中4个SNPs(G18A、A159G、G235T、C1189T)共形成10种单倍型(Hap1~Hap10),其中Hap1(GAGC)和Hap2(GAGT)是3种不同毛色水貂群体的共享单倍型;部分内含子3中6个SNPs(C252T、A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)形成4种单倍型(Hap1~Hap4),且Hap2(CCCGCC)是名威银蓝水貂群体的主体单倍型。5个位点(A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)均处于完全连锁不平衡状态。实时荧光定量PCR检测显示,金州黑水貂和名威银蓝水貂ASIP基因mRNA表达量分别是红眼白水貂的1.25和0.95倍,三者间差异不显著(P0.05)。研究结果初步提示,ASIP基因调控水貂不同毛色表型形成的分子机制可能存在差异。
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