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亚洲棉bZIP蛋白家族的鉴定及GaFDs基因的组织表达分析
引用本文:张彦楠,蔡大润,黄先忠.亚洲棉bZIP蛋白家族的鉴定及GaFDs基因的组织表达分析[J].作物学报,2016,42(6):832-843.
作者姓名:张彦楠  蔡大润  黄先忠
作者单位:石河子大学生命科学学院/植物基因组学实验室,新疆石河子 832003
基金项目:本研究由教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-12-1072), 国家自然科学基金项目(31360366)和新疆生产建设兵团博士基金项目(2012BB007)资助。
摘    要:碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper, bZIP)是真核生物中数量最多并且最具多样性的转录因子之一,参与植物生长发育及响应生物和非生物胁迫。本研究利用亚洲棉(Gossypium arboreum)全基因组数据库,通过生物信息学分析分布在13条染色体上的159个bZIPs家族基因的全序列。系统进化、基因结构和保守基序分析表明这些基因分成13个亚家族。其中,A亚家族有3个GaFD基因GaFD1、GaFD2和GaFD3,通过实时荧光定量PCR分析3个GaFDs基因在不同组织中的表达,结果表明GaFD1和GaFD2在SAM中的表达量最高,GaFD3在茎中表达量最高。研究表明棉花基因组中具有数量众多的bZIP家族成员,不同基因结构及FD基因不同的表达特征表明bZIP基因在棉花生长发育中可能具有不同的功能,这些结果为进一步解析棉花bZIP家族基因的功能和作用机理积累了有价值的资料。

关 键 词:碱性亮氨酸拉链  亚洲棉  FD  进化分析  基因表达
收稿时间:2015-11-13

Identification of bZIP Protein Family in Gossypium arboreum and Tissue Expression Analysis of GaFDs Genes
ZHANG Yan-Nan,CAI Da-Run,HUANG Xian-Zhong.Identification of bZIP Protein Family in Gossypium arboreum and Tissue Expression Analysis of GaFDs Genes[J].Acta Agronomica Sinica,2016,42(6):832-843.
Authors:ZHANG Yan-Nan  CAI Da-Run  HUANG Xian-Zhong
Institution:Plant Genomics Laboratory / College of Life Sciences, Shihezi University, Shihezi 832003, China
Abstract:
Keywords:Basic leucine zipper  Gossypium arboreum  FD  Phylogenetic analysis  Gene expression
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