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2021—2022年湖南省PRRSV流行病学调查及基因组特征分析
引用本文:周宇骏,龙明英,孟芳,王文梅,邹玖零,廖淑玲,杜雅萍,禹思宇.2021—2022年湖南省PRRSV流行病学调查及基因组特征分析[J].南方农业学报,2023(12):3748-3756.
作者姓名:周宇骏  龙明英  孟芳  王文梅  邹玖零  廖淑玲  杜雅萍  禹思宇
作者单位:2. 长沙海关技术中心;3. 宁乡市动物疫病预防控制中心;4. 永州市动物疫病预防控制中心
基金项目:湖南省自然科学基金—科教联合项目(2021JJ60091)~~;
摘    要:【目的】了解当前湖南省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行特点及主要流行基因型的占比情况,并明确其遗传进化关系及重组特征,为湖南省PRRS的科学防控提供参考依据。【方法】2021年3月—2022年10月,从湖南省14个市(州)396个疑似暴发PRRS的猪场采集1184份病料样品,采用荧光定量PCR检测PRRSV阳性率,统计不同季节和不同地区的感染情况;利用RT-PCR扩增部分阳性病料样品ORF5序列后进行序列相似性及遗传进化分析;将部分病料接种Marc-145细胞进行病毒分离,采用二代测序技术完成全基因组测序后进行遗传进化分析,并以SimPlot分析是否发生组重组事件。【结果】共有167份病料样品检测结果呈PRRSV阳性(检出率14.11%),湖南省不同地区和不同季节的PRRSV样品阳性检出率分别为0~46.43%和6.95%~19.67%;高致病性PRRSV(HP-PRRSV)株、经典株和类NADC30株的占比分别为43.11%、15.57%和41.32%。共扩增获得21株PRRSV的完整ORF5序列(600~603 bp),其中,7株与HP-PRRSV参考株的GP5氨基酸序列相...

关 键 词:猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)  流行病学调查  ORF5序列  重组分析  湖南省
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