| 陆川猪ACOX1基因不同亚型克隆及其表达差异分析 |
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| 引用本文： | 陈钊,潘鹏丞,潘星辰,陈少梅,覃兆鲜,吴永绍,覃倩,农素群,谢炳坤,陈宝剑.陆川猪ACOX1基因不同亚型克隆及其表达差异分析[J].南方农业学报,2023(12):3739-3747. |
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| 作者姓名： | 陈钊 潘鹏丞 潘星辰 陈少梅 覃兆鲜 吴永绍 覃倩 农素群 谢炳坤 陈宝剑 |
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| 作者单位： | 广西农业职业技术大学 |
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| 基金项目： | 广西重点研发计划项目（桂科AB21196060）； |
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| 摘 要： | 【目的】克隆陆川猪脂酰辅酶A氧化酶1(Acyl-CoA oxidase 1,ACOX1)基因不同亚型，进行生物信息学分析，并分析ACOX1基因及其亚型在不同品种猪背最长肌中的表达情况，为研究ACOX1基因在陆川猪机体内的功能作用提供参考依据。【方法】根据GenBank中ACOX1基因序列（NM＿001101028.1）及所克隆获得陆川猪ACOX1基因编码区（CDS）序列，设计特异性扩增和验证引物，采用TRIzol法提取0月龄陆川猪肝脏及8月龄陆川猪、杜洛克猪、杜陆猪和陆杜猪背最长肌的总RNA，反转录合成cDNA，以0月龄陆川猪肝脏cDNA为模板进行克隆和验证，获得陆川猪ACOX1基因不同亚型序列，并利用在线工具进行生物信息学分析，利用实时荧光定量PCR检测ACOX1基因不同亚型在背最长肌组织中的表达情况。【结果】陆川猪ACOX1基因存在2种亚型结构（ACOX1-Ⅰ和ACOX1-Ⅱ），NCBI登录号分别为OQ701687和OQ701688;2种亚型CDS长度均为1986 bp，共编码661个氨基酸残基，2种异构体主要是第270～429位氨基酸进行选择性剪切，陆川猪ACOX1-Ⅰ型编码蛋白...
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| 关 键 词： | 陆川猪 ACOX1基因 亚型 生物信息学分析 表达分析 |
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