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麻鸭α干扰素基因的克隆与序列分析
引用本文:陈斌,程安春,汪铭书,余勇,唐琼,石谦,张东,彭健康,陈海滨.麻鸭α干扰素基因的克隆与序列分析[J].中国兽医学报,2006,26(4):401-404.
作者姓名:陈斌  程安春  汪铭书  余勇  唐琼  石谦  张东  彭健康  陈海滨
作者单位:1. 动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川农业大学禽病防治研究中心,四川,雅安,625014;四川省动物防疫监督总站,四川,成都,610041
2. 动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川农业大学禽病防治研究中心,四川,雅安,625014
3. 四川省动物防疫监督总站,四川,成都,610041
4. 四川乐山沙湾区畜牧局,四川乐山,614000
基金项目:国家科技攻关项目;四川省重点学科建设项目
摘    要:根据GenBank文献,应用Oligo6.0分析软件设计合成了用于扩增鸭Ⅰ型干扰素(α—IFN)基因的2对引物。以麻鸭肝脏提取的基因组DNA为模板,采用Nest—PCR方法扩增获得了约600bp片段,经T载体克隆和测序分析证实,是麻鸭Ⅰ型干扰素基因(SDIFN—α)。生物信息学分析表明,SDIFN—α的开放阅读框架(ORF)由576个核苷酸所组成,预测蛋白质相对分子质量为21640,编码191个氨基酸。其中前28个氨基酸可能是信号肽部分,切割位点在28号氨基酸A和29号氨基酸S之间,序列中无内含子。成熟的多肽中含8个半胱氨酸和2个糖基化位点,2个蛋白激酶C磷酸化位点(protein kinase C phosphorylation site)和2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(casein kinase Ⅱ phosphorylation site)。SDIFN—α与鸭α—IFN基因核苷酸同源性为99.3%。有4个碱基的差异;与北京鸭α—IFN基因的核苷酸同源性为99.1%,氨基酸同源性为98.96%;与鸡α—IFN的核苷酸同源性为71.8%。与鹅、狗、牛、马和人的α—IFN基因的核苷酸同源性分别为96.0%、45.8%、45.5%、44.6%和41.7%。遗传进化分析结果表明,IFN—α的这些同源性与其动物分类地位相一致。

关 键 词:麻鸭  α干扰素基因  克隆  序列分析
文章编号:1005-4545(2006)04-0401-04
收稿时间:2004-11-30
修稿时间:2004年11月30

Molecular Cloning and Sequence Analysis of the Type Ⅰ Interferon from Ma Duck
CHEN Bin,CHENG An-chun,WANG Ming-shu,YU Yong,TANG Qiong,SHI Qian,ZHANG Dong,PENG Jian-kang,CHEN Hai-bin.Molecular Cloning and Sequence Analysis of the Type Ⅰ Interferon from Ma Duck[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2006,26(4):401-404.
Authors:CHEN Bin  CHENG An-chun  WANG Ming-shu  YU Yong  TANG Qiong  SHI Qian  ZHANG Dong  PENG Jian-kang  CHEN Hai-bin
Abstract:
Keywords:
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