| 黑果枸杞XTH转录因子家族鉴定与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 贾西贝,李效雄,杜雨,胡晓桐,刘筠,马彦军.黑果枸杞XTH转录因子家族鉴定与生物信息学分析[J].草地学报,2023(10):2916-2924. |
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| 作者姓名： | 贾西贝 李效雄 杜雨 胡晓桐 刘筠 马彦军 |
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| 作者单位： | 1. 甘肃农业大学林学院;2. 兰州资源环境职业技术大学 |
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| 基金项目： | 兰州市科技计划项目(2022-2-22)资助； |
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| 摘 要： | 为探究木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase, XTHs)基因家族在黑果枸杞(Lycium ruthenicum)生长发育中的作用，以及对盐胁迫的响应，本文通过生物信息学方法对XTHs基因的理化性质、保守结构域、进化关系和表达模式进行分析。从黑果枸杞转录组数据中共筛选出19个LrXTHs成员，其编码氨基酸的数目为258～330 aa,分子量为29.77～37.98 kDa,等电点为4.98～8.92,基因长度为954～1 814 bp。LrXTHs成员都含DE(I/L/F/V)D(F/I/M)EFLG保守结构域。系统发育树显示XTH基因家族可分为4个亚族。基因表达谱显示不同组织中的LrXTHs在盐胁迫下具有不同的表达趋势，LrXTH3,LrXTH18和LrXTH19在根部组织中高表达，LrXTH9在根部和叶部组织中高表达，表明LrXTHs可能在黑果枸杞的盐胁迫响应中发挥重要作用。该结果为黑果枸杞及XTH家族的进一步研究提供了参考。
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| 关 键 词： | 黑果枸杞 NaCl胁迫 XTH转录因子 生物信息学 系统发育树 |
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