| 青海草原毛虫转录组分析及SSR位点开发 |
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| 引用本文： | 南彦斌,许嘉诚,何啟玥,潘学能,周渊涛.青海草原毛虫转录组分析及SSR位点开发[J].草地学报,2023(9):2653-2662. |
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| 作者姓名： | 南彦斌 许嘉诚 何啟玥 潘学能 周渊涛 |
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| 作者单位： | 青海大学农牧学院 |
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| 摘 要： | 青海草原毛虫(Gynaephora qinghaiensis)是青藏高原牧区重要的害虫之一。本研究采用Illumina HiSeqTM2000高通量测序平台对青海草原毛虫成虫和4龄幼虫进行转录组测序，在此基础上筛选其微卫星(Single sequence reperts, SSR)位点并挖掘微卫星引物。本研究共获得63 335条unigenes,有12 597个微卫星位点分布于9 851条unigenes中。通过KOG,GO注释和KEGG通路数据库分析发现，unigenes注释主要集中于一般功能预测、细胞进程和碳水化合物代谢过程。SSR重复类型主要为单核苷酸和二核苷酸重复，(A/T)n是单核苷酸重复中最主要的基元类型，占总SSR位点的71.37%,(AC/GT)n为二核苷酸重复的优势基元，占总SSR位点数的6.06%,且SSR数量随重复次数增加而降低，重复次数类型随基元序列长度增长而减少。利用Primer 3软件设计出2 714对青海草原毛虫SSR引物，随机挑出25对引物进行PCR验证，有11对引物扩增出目的DNA片段。...
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| 关 键 词： | 青海草原毛虫 转录组分析 微卫星 分子标记 |
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