| 藏羊IFN-γ基因的扩增、序列分析及蛋白结构预测 |
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| 引用本文： | 张晓芬,冶贵生,文熙萍,祁秀清.藏羊IFN-γ基因的扩增、序列分析及蛋白结构预测[J].动物医学进展,2016(11):8-13. |
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| 作者姓名： | 张晓芬 冶贵生 文熙萍 祁秀清 |
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| 作者单位： | 青海大学农牧学院，省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室，青海西宁 810016 |
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| 基金项目： | 青海省科技厅项目(2016-ZJ-738)；青海大学“123高层次人才培养工程”项目 |
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| 摘 要： | 为了研究藏羊IFN-γ基因的功能,提取藏羊脾脏总RNA,通过RT-PCR扩增藏羊IFN-γ基因并测序,应用DNA Star软件进行序列分析及编码蛋白结构预测。结果表明,藏羊IFN-γ基因长度为429bp,其中腺嘌呤和胸腺嘧啶含量较高,该基因编码143个氨基酸,其中疏水性氨基酸和亲水性氨基酸的含量较高。藏羊IFN-γ基因与参考绵羊、山羊、藏羚羊和牛IFN-γ基因的核苷酸序列同源性依次为100%、99.3%、99.1%和97.2%,氨基酸序列同源性依次为100%、99.3%、99.3%和95.8%。IFN-γ蛋白主要由α螺旋组成,亲水性较高,含有5种蛋白质功能位点,分别为1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个酰胺化位点、2个N-糖基化位点、2个cAMP和cGMP依赖的蛋白激酶磷酸化位点和3个蛋白激酶C磷酸化位点。
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| 关 键 词： | 藏羊 IFN-γ基因 反转录-聚合酶链反应 序列分析 蛋白结构预测 |
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