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郑丰5号α-醇溶蛋白基因的克隆与序列分析
引用本文:李玉阁,邢冉冉,崔一飞,李锁平.郑丰5号α-醇溶蛋白基因的克隆与序列分析[J].华北农学报,2013(4).
作者姓名:李玉阁  邢冉冉  崔一飞  李锁平
作者单位:河南大学 生命科学学院,河南 开封,475004
基金项目:“十二五”农村领域国家科技计划项目(2011BAD07B00;2012AA101105);自然科学基金面上项目
摘    要:α-醇溶蛋白是小麦籽粒贮藏蛋白的重要组分,其组成与含量对小麦加工品质具有重要影响。利用PCR从郑丰5号基因组中克隆α-醇溶蛋白基因,并对其序列进行分析。经克隆共获得32个α-醇溶蛋白新基因( ZF5 A-1~ZF5A-32,GenBank注册序列号为JX828280~JX828311),其中15个为假基因,17个(ZF5A-1~ZF5A-17)具有完整开放阅读框。17个α-醇溶蛋白新基因中,除ZF5A-1、ZF5A-3、ZF5A-6、ZF5A-9、ZF5A-10、ZF5A-11、ZF5A-15编码的蛋白在特征Ⅱ区含有1个额外的半胱氨酸( C)外,其他10个基因编码的蛋白均具有α-醇溶蛋白的典型结构。根据推断氨基酸序列中4种主要T细胞优势多肽的分布及多聚谷氨酰胺区的长度,推测ZF5A-7和ZF5A-12可能定位于6A染色体,ZF5A-4、ZF5A-13、ZF5A-14和ZF5A-17可能定位于6B染色体,而ZF5A-1~ZF5A-3、ZF5A-5、ZF5A-6、ZF5A-8~ZF5A-11、ZF5A-15和ZF5A-16可能定位于6D染色体。17个新克隆α-醇溶蛋白基因及4个已知α-醇溶蛋白基因编码的蛋白的二级结构预测结果表明:α-螺旋、β-折叠的位置和核心序列是相对保守的,但不同蛋白α-螺旋和β-折叠的数量以及参与形成同一保守区域α-螺旋和β-折叠的氨基酸残基数却并不相同。克隆的17个α-醇溶蛋白基因中,除ZF5A-17编码的蛋白缺少α-螺旋( H2)、ZF5A-2、ZF5A-8编码的蛋白在特征区Ⅰ均存在1个额外的α-螺旋( HE1)、GQ891685和ZF5A-15编码的蛋白在多聚谷氨酰胺Ⅱ区存在1个额外的α-螺旋( HE2)外,5个保守的α-螺旋( H1~H5)恒定出现在其他基因的2个谷氨酰胺重复区和特征区中;此外,在C-末端特征区大部分基因(61.11%)还形成1个β-折叠结构( E)。郑丰5号中具有较多额外半胱氨酸、α-螺旋和β-折叠的α-醇溶蛋白基因,可能与其良好的加工品质密切相关。

关 键 词:α-醇溶蛋白  郑丰5号  克隆  序列分析

Cloning and Sequencing of α-gliadin Genes from Common Wheat Cultivar Zhengfeng 5
LI Yu-ge , XING Ran-ran , CUI Yi-fei , LI Suo-ping.Cloning and Sequencing of α-gliadin Genes from Common Wheat Cultivar Zhengfeng 5[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2013(4).
Authors:LI Yu-ge  XING Ran-ran  CUI Yi-fei  LI Suo-ping
Abstract:
Keywords:α-gliadin  Zhengfeng 5  Gene clonging  Sequence analysis
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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