| 青花菜高温和盐胁迫相关LncRNAs的鉴定与表达特征分析 |
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| 引用本文： | 裴徐梨,荆赞革,唐 征,罗天宽.青花菜高温和盐胁迫相关LncRNAs的鉴定与表达特征分析[J].西北农业学报,2022(5):620-627. |
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| 作者姓名： | 裴徐梨 荆赞革 唐 征 罗天宽 |
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| 作者单位： | （1.昆明学院 农学与生命科学学院，昆明 650214；2.温州科技职业学院 农业与生物技术学院，浙江温州 325006） |
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| 基金项目： | 浙江省自然科学基金(LY18C150006)；云南省地方本科高校（部分）基础研究联合专项(2018FH001-044)；云南省科技厅基础研究专项青年项目(2019-1-C-25318000002236)；浙江省科技厅项目（2016C051-5-3）；温州市科技项目（2019ZX007-2）。 |
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| 摘 要： | 为探讨长链非编码RNA在青花菜高温和盐胁迫中的功能。以青花菜高代自交系‘WN12-95B’为试验材料，通过RNA-seq测序、靶基因注释和qRT-PCR分析，筛选出与青花菜高温和盐胁迫相关的LncRNA。在青花菜高温和盐胁迫文库中鉴定到2 432条LncRNAs，筛选获得158个差异LncRNAs，其中96个上调表达，62个下调表达。序列特征分析发现LncRNAs的长度较mRNA短，外显子个数也比mRNA少。靶基因注释显示差异LncRNAs可通过谷胱甘肽代谢、信号转导以及氧化磷酸化等参与青花菜高温和盐胁迫响应。qRT-PCR分析结果显示10个挑选的差异LncRNAs在盐胁迫和高温胁迫中的表达趋势各具特点。 XLOC_033957、 XLOC_034964、 XLOC_005515、 XLOC_027154、 XLOC_023592和 XLOC_035830在高温胁迫下呈现先下降再上升的模式，但在盐胁迫中其表达模式存在差异。 XLOC_033671、 XLOC_003826、 XLOC_06988和 XLOC_024730在盐胁迫下呈持续上调表达，在高温胁迫下先上升后下降。通过测序及数据分析，鉴定出青花菜高温和盐胁迫相关的LncRNA的相关基因，为进一步分析LncRNAs在青花菜高温和盐胁迫下的调控机制提供一定的基础。
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| 关 键 词： | 青花菜 非生物胁迫 长链非编码RNA 表达特征 |
Identification and Expression Analysis of LncRNAs Related to High Temperature and Salt Stress in Broccoli |
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| PEI Xuli,JING Zange,TANG Zheng and LUO Tiankuan.Identification and Expression Analysis of LncRNAs Related to High Temperature and Salt Stress in Broccoli[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2022(5):620-627. |
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| Authors: | PEI Xuli JING Zange TANG Zheng and LUO Tiankuan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Broccoli Abiotic stress LncRNA Expression characteristics |
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