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茄子谷氨酸酯-1-半醛2,1氨基变位酶基因克隆和序列分析
引用本文:余桃,孙晶,刘莉,邹梦倩,王倩,张爱慧.茄子谷氨酸酯-1-半醛2,1氨基变位酶基因克隆和序列分析[J].金陵科技学院学报,2019(3).
作者姓名:余桃  孙晶  刘莉  邹梦倩  王倩  张爱慧
作者单位:金陵科技学院园艺园林学院;安徽农业大学园艺学院
摘    要:基于茄子基因组数据库,以番茄同源基因序列为探针,通过电子克隆手段获得茄子谷氨酸酯-1-半醛2,1氨基变位酶基因,命名为SmGSA。对该基因编码蛋白从氨基酸组成、蛋白的各级结构及其理化性质等方面进行了预测和分析。结果表明,该基因包含一个长度为1 044 bp的开放阅读框,共编码347个氨基酸,蛋白质分子式预测为C_(3 137)H_(5 232 )N_(1 044)O_(1 322)S_(211),分子量大小为85.5 KDa,为亲水性蛋白;α-螺旋、延伸链和无规卷曲是该蛋白结构的主要构成元件;该蛋白中共存在9处跨膜区,内部到外部螺旋发现4个,外部到内部螺旋发现5个。

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