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水稻粒质量和粒形QTL定位及粒长位点qGL3.2的鉴定
引用本文:游佳,谷晗,朱泽,肖世卓,王致远,刘子文,胡曼曼,刘世家,陈亮明,刘喜,田云录,江玲,刘玲珑.水稻粒质量和粒形QTL定位及粒长位点qGL3.2的鉴定[J].南京农业大学学报,2019(4).
作者姓名:游佳  谷晗  朱泽  肖世卓  王致远  刘子文  胡曼曼  刘世家  陈亮明  刘喜  田云录  江玲  刘玲珑
作者单位:南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏省植物基因工程技术研究中心
摘    要:目的]通过水稻粒质量和粒形相关基因的QTL分析,挖掘普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)中优异基因,为高产水稻资源的鉴定与品种改良提供研究基础和创新材料。方法]以籼稻品种‘9311’为受体亲本,普通野生稻为供体亲本构建的染色体片段置换系群体为研究材料,考察2015、2016和2017年水稻种子千粒质量、粒长、粒宽和长宽比等性状,利用QTL IciMapping 4.1软件对控制籽粒大小的QTL进行定位分析。并利用‘9311’与小粒家系Q8衍生的次级F_2群体验证第3染色体1个效应明显的QTL(qGL3.2)。结果]3年共定位到16个QTL,分布于第2、3、6、8和11染色体上,解释遗传变异的4.52%~13.08%。‘9311’与Q8家系衍生的次级F_2群体验证了标记Indel3-17和RM3646之间qGL3.2位点的真实性,其对千粒质量、粒宽和长宽比的贡献率分别为33.18%、8.76%和59.92%;对粒长的效应尤为明显,LOD值高达39.29,可解释表型变异的贡献率达61.43%。精细定位和测序分析表明qGL3.2在基因Os03g0407400编码区发生1个C-A的替换,导致蛋白翻译提前终止。对130份种质资源等位变异类型和籽粒长度的分析表明C-A等位变异与粒长高度相关。结论]qGL3.2位点Os03g0407400基因C-A突变对水稻粒质量和粒形有重要影响,这为该基因的进一步育种利用和分子标记辅助选择提供依据。

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