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猪肥胖基因ob近端启动子的生物信息学分析
引用本文:李毅,张嘉保,赵志辉,武霞,张树敏.猪肥胖基因ob近端启动子的生物信息学分析[J].广西农业生物科学,2006,25(Z1):31-33.
作者姓名:李毅  张嘉保  赵志辉  武霞  张树敏
作者单位:1. 吉林大学,实验动物中心,吉林,长春,130062
2. 吉林大学,畜牧兽医学院,吉林,长春,130062
3. 吉林省农科院,畜牧分院,吉林,公主岭,136100
基金项目:国家振兴东北老工业基地科技攻关项目 , 吉林省牧业科技基金
摘    要:通过检索网上数据库资料,获得ob的转录本信息;利用F irstEF等预测程序分析并获得ob的启动子序列,并使用M atlspector程序对启动子序列的转录因子结合位点进行预测。结果表明,目前已知的ob转录本中,5′UTR区最长的序列为AF 492499(G enB ank登录号);利用F irstEF等预测程序分析成功获得了长度为529 bp的猪ob的启动子序列,M atlspector程序分析该启动子中含有24个转录因子结合位点,包括TATA盒、SP 1、C/EBP等多种顺式反应元件。通过分析获得了猪ob启动子序列及其转录调控信息。

关 键 词:ob基因  转录调控  生物信息学
文章编号:1008-3464(2006)增-0031-03
修稿时间:2006年8月13日

Bioinformatic analysis of swine ob proximal promoter
LI Yi,ZHANG Jia-bao,ZHAO Zhi-hui,WU Xia,ZHANG Shu-min.Bioinformatic analysis of swine ob proximal promoter[J].Journal of Guangxi Agricultural and Biological Science,2006,25(Z1):31-33.
Authors:LI Yi  ZHANG Jia-bao  ZHAO Zhi-hui  WU Xia  ZHANG Shu-min
Abstract:
Keywords:ob gene  promoter  bioinformatics
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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