| 腥黑粉菌属3种检疫性真菌rDNA-IGS区的扩增及其序列分析 |
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| 引用本文： | 梁宏,彭友良,张国珍,陈万权,刘太国.腥黑粉菌属3种检疫性真菌rDNA-IGS区的扩增及其序列分析[J].植物病理学报,2006,36(5):407-412. |
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| 作者姓名： | 梁宏 彭友良 张国珍 陈万权 刘太国 |
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| 作者单位： | 1 中国农业大学农学与生物技术学院, 北京 100094;2 中国农业科学院植物保护研究所, 北京 100094 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划) |
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| 摘 要： | 为了发掘腥黑粉菌属检疫性真菌的特异性分子标记,本研究对来自不同地区的3种检疫性腥黑粉菌:小麦矮腥黑穗病菌(Tilletia controversa)、小麦网腥黑穗病菌(T. caries)和小麦光腥黑穗病菌(T. foetida)的IGS区进行了PCR扩增和序列测定,其IGS1和IGS2区的长度分别为1 511~1 513bp和1 196~1 199bp,G+C含量分别为52.6%和49.0%。用DNA-MAN软件进行比对分析发现,这3种真菌在IGS1区存在不同程度的多态性,而IGS2区的保守性很强,没有特异性的碱基位点存在。依据它们在IGS1区序列的差异,设计了一对特异性引物,可用于T. foetida的分子检测,这是首次利用分子生物学技术对该菌进行鉴定。
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| 关 键 词： | 腥黑粉菌属 小麦光腥黑穗病菌 IGS 特异性引物 |
| 文章编号： | 0412-0914(2006)05-0407-06 |
| 修稿时间： | 2006年1月16日 |
Amplification and sequence analysis of the rDNA intergenic spacer (rDNA-IGS) from three Tilletia species |
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| LIANG Hong,PENG You-liang,ZHANG Guo-zhen,CHEN Wan-quan,LIU Tai-guo.Amplification and sequence analysis of the rDNA intergenic spacer (rDNA-IGS) from three Tilletia species[J].Acta Phytopathologica Sinica,2006,36(5):407-412. |
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| Authors: | LIANG Hong PENG You-liang ZHANG Guo-zhen CHEN Wan-quan LIU Tai-guo |
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| Institution: | 1 College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100094, China;2 Institute of Plant Protection, CAAS, Beijing 100094, China |
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| Abstract: | In order to find specific molecular markers for detecting the genus Tilletia at species level,the(rDNA-IGSs) of different strains of Tilletia controversa,T.foetida and T.caries were amplified and sequenced.The nucleotide sequences of IGS1 and IGS2 varied in length from 1 511 to 1 513 bp and 1 196 to(1 199) bp with average G+C content 52.6% and 49.0%,respectively.The results of sequence alignment(analysis) using DNAMAN indicated that the IGS1 was more variable than the IGS2 among the three species.Based on the sequence differences in IGS1,a pair of primers was designed and could be used to detect T.foetida specifically by PCR amplification.This is the first report about identification of T.foetida by molecular techniques. |
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| Keywords: | IGS |
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