| 基于转录组测序筛选乌苏里白鲑肌肉生长关键候选基因研究 |
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| 作者姓名： | 李文文 徐革锋 黄天晴 谷伟 刘恩慧 王高超 潘玉财 周金鑫 姜再胜 王炳谦 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306；冷水性鱼类产业技术创新战略联盟 中国水产科学研究院
黑龙江水产研究所 黑龙江 哈尔滨 150070;冷水性鱼类产业技术创新战略联盟 中国水产科学研究院
黑龙江水产研究所 黑龙江 哈尔滨 150071;冷水性鱼类产业技术创新战略联盟 中国水产科学研究院
黑龙江水产研究所 黑龙江 哈尔滨 150072;冷水性鱼类产业技术创新战略联盟 中国水产科学研究院
黑龙江水产研究所 黑龙江 哈尔滨 150073;冷水性鱼类产业技术创新战略联盟 中国水产科学研究院
黑龙江水产研究所 黑龙江 哈尔滨 150074;冷水性鱼类产业技术创新战略联盟 中国水产科学研究院
黑龙江水产研究所 黑龙江 哈尔滨 150075;冷水性鱼类产业技术创新战略联盟 中国水产科学研究院
黑龙江水产研究所 黑龙江 哈尔滨 150076;安徽省桐城市水产服务中心 安徽 桐城 231400 |
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| 摘 要： | 为了挖掘调控乌苏里白鲑(Coregonus ussurinsis Berg)肌肉生长的关键候选基因，本研究对不同生长速度乌苏里白鲑的肌肉组织进行转录组测序，以期为乌苏里白鲑群体选育提供基础数据。首先，在同等条件下(从混合池中)随机选择乌苏里白鲑F2个体进行实验分组(快长组和慢长组)。接着分别从快长组体重为(219.20±38.66) g]和慢长组体重为(74.30±17.86) g]中随机选取10尾样本，取其背部肌肉进行转录组测序。以FDR (false discovery rate)<0.05且|log2(FC)|>1 (FC, fold change)为条件筛选差异表达基因并对其进行GO (gene ontology)和KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析，并通过qPCR验证转录组数据的准确性。转录组测序结果显示，共筛选出2 211个差异表达基因，与慢长组相比，快长组中583个差异基因表达上调及1 628个基因表达下调。GO功能注释结果显示，差异基因主要参与细胞过程和结合过程，差异基因显著富集到251条KEGG通路(P<0.05)，其中，MAPK信号通路(MAPK signaling pathway)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、紧密连接(tight junction)、胰岛素信号通路(insulin signaling pathway)、糖酵解/糖异生(glycolysis/gluconeogenesis)和PPAR信号通路(PPAR signaling pathway)参与细胞生长。之后结合功能注释结果和KEGG，鉴定出肌浆/内质网钙ATP酶基因atp2a1和atp2a2、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因g6pc、生长因子结合蛋白1基因igfbp1以及肌球蛋白重链基因myh1、myh4、myh6、myh7、myh9和myh13等可能与肌肉生长密切相关的基因。本研究共筛选出10个可能与乌苏里白鲑肌肉生长相关的关键候选基因，为今后乌苏里白鲑分子标记辅助育种提供了基础数据。
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| 关 键 词： | 乌苏里白鲑 转录组测序 差异表达基因 肌肉生长 |
| 收稿时间： | 2022/12/5 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/2/9 0:00:00 |
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