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草地贪夜蛾RACK1基因生物信息学及表达分析
引用本文:何凯,邓凡,严哲钰,张尚志.草地贪夜蛾RACK1基因生物信息学及表达分析[J].湖南农业科学,2023(1):1-8.
作者姓名:何凯  邓凡  严哲钰  张尚志
作者单位:1. 湖南人文科技学院农业与生物技术学院;2. 湖南省农田杂草防控技术与应用协同创新中心
基金项目:湖南省自然科学青年基金(2022JJ40195);;湖南省教育厅科学研究重点项目(21A0560);
摘    要:蛋白激酶C受体l(Receptor for Activated C Kinase 1,RACKl)是WD40家族的成员,其作为稳定蛋白激酶C(Protein Kinases C,PKC)的受体,参与了多种生理活动。课题组前期从转录组数据中筛选获得了草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)的RACK1序列,该研究通过生物信息软件对SfRACK1进行生物信息学分析,并以氨基酸序列为基础与其他昆虫的RACK1进行同源性比较;同时分析RACK1在草地贪夜蛾不同发育阶段不同组织以及NPV刺激后不同时间段的表达模式,探究草地贪夜蛾RACK1的功能以及该基因是否应答NPV刺激。结果表明:草地贪夜蛾RACK1的ORF序列长度为960 bp,可编码319个氨基酸,包含有7个重复的WD40结构域,预测其分子量和等电点分别为35.9 kDa和8.07,未发现信号肽和跨膜结构;多重序列比对及进化树分析表明,SfRACK1与棉铃虫、小菜蛾等鳞翅目昆虫亲缘关系较近;组织表达及时空表达结果表明,SfRACK1基因在脂肪体及成虫期具有较高的表达水平,而在表皮和卵中的表达量较低;当草地贪夜蛾受到NPV侵...

关 键 词:蛋白激酶C受体l  草地贪夜蛾  核型多角体病毒  生物信息学  表达分析
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