| 蔗茅野生种响应低温胁迫的数字基因表达谱 |
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| 引用本文： | 孟玉,陈疏影,徐荣,曹哲群,刘鲁峰,王先宏,何丽莲,李富生.蔗茅野生种响应低温胁迫的数字基因表达谱[J].分子植物育种,2018(12). |
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| 作者姓名： | 孟玉 陈疏影 徐荣 曹哲群 刘鲁峰 王先宏 何丽莲 李富生 |
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| 作者单位： | 云南农业大学农学与生物技术学院 |
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| 摘 要： | 以蔗茅野生种(昆明蔗茅99-1)为材料,利用数字基因表达谱(DGE)技术,对4℃低温胁迫处理后的蔗茅野生种构建的c DNA文库进行差异基因表达谱分析。结果表明,低温处理24 h(ER-LT1)有2 391个基因,低温处理72 h(ER-LT2)有4 892个基因因低温处理而发生表达变化。GO功能显著性富集分析表明,差异基因主要涉及对非生物刺激反应、氧化还原过程、能量代谢以及催化活性。KEGG富集分析表明,两个不同处理时间下共同富集的通路主要为植物激素信号转导途径、植物-病原体互作通路、光合作用通路、淀粉和蔗糖代谢途径和苯丙烷生物合成途径等。利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)验证2个在低温胁迫条件下的差异表达基因,其结果与DGE分析结果基本一致,证实了DGE测序结果的可靠性。
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