| 基于生物信息学的胶孢炭疽菌效应分子的筛选 |
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| 引用本文： | 赵美,郑文博,皮磊,周而勋,舒灿伟.基于生物信息学的胶孢炭疽菌效应分子的筛选[J].分子植物育种,2018(18). |
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| 作者姓名： | 赵美 郑文博 皮磊 周而勋 舒灿伟 |
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| 作者单位： | 华南农业大学农学院广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室 |
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| 摘 要： | 隶属炭疽菌属的胶孢炭疽菌(C. gloeosporioides)是农业和林业生产上重要的病原真菌,可以引起两百多种植物产生病害,对农林业造成严重的经济损失。效应蛋白在胶孢炭疽菌侵染寄主植物的过程发挥了关键作用。为了能筛选出胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)的效应蛋白,以便开展对该菌与寄主的互作研究。本研究利用已经发表的胶孢炭疽菌的基因组序列,根据效应蛋白的主要特征,利用一系列生物信息分析服务器(SignalP, TMHMM, Protcomp, big-PI Predictor, TargetP和Blast),对该菌的效应蛋白进行预测和分析。我们共分析了胶孢炭疽菌的15 381个蛋白质序列,最后获得了443个符合效应蛋白特征的候选效应子,其中有86个具有预测功能。本研究为阐明炭疽病与植物寄主之间的相互作用提供理论依据。
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