| 观赏海棠'火焰'果皮中可变剪接基因分析 |
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| 引用本文： | 段诗瑶,田佶,张杰.观赏海棠'火焰'果皮中可变剪接基因分析[J].北京农学院学报,2021,36(1):8-14. |
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| 作者姓名： | 段诗瑶 田佶 张杰 |
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| 作者单位： | 北京农学院植物科学技术学院/农业应用新技术北京市重点实验室,北京102206;北京农学院植物科学技术学院/农业应用新技术北京市重点实验室,北京102206;北京农学院植物科学技术学院/农业应用新技术北京市重点实验室,北京102206 |
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| 摘 要： | 目的]研究观赏海棠'火焰'果皮中可变剪接基因.方法]利用已有苹果属观赏海棠品种'火焰'果皮转录组测序数据,分析可变剪接类型和数量,并对发生可变剪接的基因进行KEGG分析,研究观赏海棠可变剪接基因与其发育过程的关系.结果]在观赏海棠果皮发育过程中,主要发生的可变剪接是第一个外显子可变剪接和最后一个外显子可变剪接两种类型.可变剪接在果皮发育前期发生较多,同时KEGG通路分析表明可变剪接主要发生在嘌呤代谢、氧化磷酸化、糖酵解/糖异生等通路过程中.结论]可变剪接在观赏海棠果皮的整个发育过程中普遍存在.观赏海棠果皮发育过程中共有的可变剪接基因主要与磷酸化和糖代谢有关.
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| 关 键 词： | 苹果 可变剪接 转录组测序技术 |
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