| 青天葵HMGR 基因片段的鉴定
和生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 黄琼林,何 瑞,詹若挺.青天葵HMGR 基因片段的鉴定
和生物信息学分析[J].广东农业科学,2015,42(21):140-144. |
| |
| 作者姓名： | 黄琼林 何 瑞 詹若挺 |
| |
| 作者单位： | 1. 广东医学院，广东 湛江 524023；2. 广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心，
广东 广州 510006；3. 岭南中药资源教育部重点实验室，广东 广州 510006 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金（30701090）；广东省
自然科学基金博士启动项目（2015A030310519）；广东医
学院博士学位人员科研启动项目（B2013017） |
| |
| 摘 要： | 采用生物信息学对青天葵转录组测序获取的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶编码基因片段Nf HMGR及其编码蛋白进行功能鉴定和表达分析。结果表明,Nf HMGR基因片段序列长度为1 563 bp,与其他植物HMGR基因的同源性最高可达88%;编码含有521个氨基酸、分子量约为55.34 ku的亲水性不稳定蛋白。Nf HMGR蛋白具有3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶Ⅰ类酶功能域,归属于3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶超级家族,包含3处跨膜结构域,不含任何信号肽、转运肽,二级结构表现为混合型结构蛋白质。在青天葵不同组织中,Nf HMGR基因在球茎中的表达量高于在叶片中的表达量。
|
| 关 键 词： | 青天葵 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A 还原酶 生物信息学 功能鉴定 表达分析 |
Identification and bioinformatics analysis of
HMGR gene fragment in Nervilia fordii |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《广东农业科学》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《广东农业科学》下载免费的PDF全文 |
|
