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黄鳝生长差异基因发掘及其调控机制初步研究
引用本文:霍欢欢,刘瑜,周秋白,郭枫,隗黎丽,彭墨,张燕萍,陈文静.黄鳝生长差异基因发掘及其调控机制初步研究[J].南方水产科学,2020,16(1):1-8.
作者姓名:霍欢欢  刘瑜  周秋白  郭枫  隗黎丽  彭墨  张燕萍  陈文静
作者单位:江西农业大学动物科学技术学院,江西南昌330045;江西省水产科学研究院,江西南昌330045
基金项目:国家特色淡水鱼产业体系建设专项资金(CARS-46);国家自然科学基金项目(31360641)
摘    要:为揭示黄鳝(Monopterus albus)生长相关基因的调控机制,对相同亲本具有显著性生长差异的黄鳝肝脏进行了转录组测序分析。结果显示,转录组测序共得到19149个基因,其中差异基因598个,差异基因中有303个基因显著上调,295个显著下调。KEGG通路分析发现,598个差异基因分属262条通路中,其中有38条通路显著富集。GO功能注释发现,与生长相关的差异基因有7个,分别为col1α1、nkx6.1、nnos、plexina4、igfbp1、pcgf1和h3.3,这些基因表达水平的变化可能对黄鳝神经、内分泌和消化系统的发育及生理活动产生了调节作用从而影响了黄鳝的生长。结合KEGG通路分析发现,col1α1所在的利什曼病通路和nnos所在的精氨酸和脯氨酸代谢通路富集显著,说明其对黄鳝生长具有重要调节作用。

关 键 词:黄鳝  转录组测序  生长差异基因

Primary study on differentially expressed genes screening of Monopterus albus and their regulation mechanism
HUO Huanhuan,LIU Yu,ZHOU Qiubai,GUO Feng,WEI Lili,PENG Mo,ZHANG Yanping,CHEN Wenjing.Primary study on differentially expressed genes screening of Monopterus albus and their regulation mechanism[J].South China Fisheries Science,2020,16(1):1-8.
Authors:HUO Huanhuan  LIU Yu  ZHOU Qiubai  GUO Feng  WEI Lili  PENG Mo  ZHANG Yanping  CHEN Wenjing
Institution:(College of Animal Science and Technology,Jiangxi Agricultural University,Nanchang 330045,China;Jiangxi Fisheries Research Institute,Nanchang 330045,China)
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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