| 基于线粒体Cytb基因序列的西江流域广西境内卷口鱼遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 彭敏,韩耀全,王大鹏,施军,吴伟军,李育森,雷建军,何安尤.基于线粒体Cytb基因序列的西江流域广西境内卷口鱼遗传多样性分析[J].南方水产科学,2020,16(5). |
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| 作者姓名： | 彭敏 韩耀全 王大鹏 施军 吴伟军 李育森 雷建军 何安尤 |
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| 作者单位： | 广西水产科学研究院/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西 南宁 530021;广西水产科学研究院/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西 南宁 530021;华南农业大学海洋学院,广东 广州 510642 |
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| 基金项目： | 公益性行业(农业)科研专项;广西壮族自治区科技重大专项;广西自然科学基金重大项目 |
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| 摘 要： | 为了解西江流域广西境内卷口鱼(Ptychidio jordani)种群遗传结构及分化程度,采用线粒体Cytb基因序列对西江流域广西境内6个江段的139尾野生卷口鱼的遗传多样性进行了分析。结果显示,线粒体Cytb基因长度为1 053 bp,碱基T、C、A、G的平均含量分别为29.1%、27.7%、29.3%、13.9%,其中A+T (58.4%)高于C+G(41.6%)。共定义20个单倍型,并聚为2个分支,未观察到明显的地理聚群。6个卷口鱼群体的平均单倍型多样性和平均核苷酸多样性分别为0.768 2、0.002 3,其中红水河群体(单倍型多样性h=0.748 7,核苷酸多样性π=0.003 3)遗传多样性最高,柳江群体(h=0.274 4,π=0.000 4)和左江群体(h=0.374 7,π=0.000 3)的遗传多样性相对较低。卷口鱼总体的遗传分化指数(F_(ST))为0.461 4 (P0.01),表现出较大的遗传分化。两两群体间遗传分化结果显示,左江和柳江种群之间的遗传分化程度最大,而柳江和西江之间最小。AMOVA分析表明西江流域的卷口鱼群体遗传变异一半来自群体内(53.86%),一半来自群体间(46.14%)。中性检验(Tajima's D=-1.082 8,P0.05;Fu's Fs=-6.572 5, 0.01P0.05)与碱基错配分布分析表明西江流域卷口鱼种群大约在0.07～0.187 Ma经历了种群扩张。综上,西江流域广西境内的卷口鱼柳江群体和左江群体遗传多样性较低,总群体分化程度较大,但仍属于一个种群,其中空间距离与地理阻隔对卷口鱼的遗传分化具有一定的促进作用。
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| 关 键 词： | 卷口鱼 遗传分化 遗传多样性 Cytb基因 西江流域 |
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