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大白菜WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析
引用本文:蒋明,苗立祥,张豫超,管铭,潘小翠.大白菜WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析[J].浙江农业学报,2013,25(5):0.
作者姓名:蒋明  苗立祥  张豫超  管铭  潘小翠
作者单位:1.台州学院 生命科学学院,浙江 临海 317000;2.浙江省农业科学院 园艺研究所,浙江 杭州 310021
摘    要:WRKY转录因子是一类重要的调控分子,在高等植物中以基因家族的形式存在。试验以大白菜基因组数据为材料,利用生物信息学手段对WRKY转录因子进行了全基因组鉴定与分析。结果表明,大白菜至少有134个WRKY转录因子,蛋白序列长度为143~1 082;基因组DNA全长880~9 099 bp,具1~15个内含子。染色体定位结果表明,10条染色体上均有WRKY转录因子基因的分布,A3染色体上最多(26),A10染色体分布最少(4)。大白菜WRKY转录因子可分为3大类,Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为27,83和24,它们处于进化树的不同分支。除保守的WRKYGQK和常见变异序列WRKYGKK外,新发现WRKDGQK,WRKNGQK和WMKYGQK等3种WRKY结构域类型。

关 键 词:大白菜  WRKY转录因子  全基因组  序列分析  
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