甘薯IbGATA16基因的克隆与表达分析 |
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引用本文: | 王崇,王连军,雷剑,靳晓杰,柴沙沙,邹语嫣,杨新笋,程贤亮,焦春海,田小海.甘薯IbGATA16基因的克隆与表达分析[J].热带作物学报,2023(12):2477-2484. |
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作者姓名: | 王崇 王连军 雷剑 靳晓杰 柴沙沙 邹语嫣 杨新笋 程贤亮 焦春海 田小海 |
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作者单位: | 1. 长江大学农学院;2. 湖北省农业科学院粮食作物研究所 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(No.2019YFD1001305);;国家现代甘薯产业技术体系建设项目(No.CARS-10); |
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摘 要: | GATA类转录因子在调控植物响应非生物胁迫中发挥重要作用。本研究从甘薯中克隆出1个IbGATA16基因,对其进行生物信息学分析,并对IbGATA16基因在甘薯干旱和盐胁迫处理中的表达模式进行分析。结果表明:甘薯IbGATA16基因CDS序列全长420bp,编码139个氨基酸,蛋白分子量为15.39kDa,等电点为9.97;IbGATA16基因组全长为582 bp,包含3个外显子和2个内含子;IbGATA16为不稳定的亲水性脂溶蛋白,亚细胞定位预测显示该蛋白定位于细胞核,具有C-X2-C-X17-C-X2-C结构域,属于典型的GATA类转录因子。IbGATA16基因上游1382bp的启动子序列存在多种顺式作用元件,如MYB、ABRE、GARE-motif等。多重序列比对和系统进化树分析结果显示,IbGATA16蛋白与三裂叶薯ItGATA16的亲缘关系最近,N端的锌指结构域序列高度一致,表明二者可能具有相似的功能。实时荧光定量结果表明,IbGATA16在甘薯根、茎、叶片等组织中均有表达,在叶中的表达量显著高于茎与根的表达量。IbGATA16对干旱和盐胁迫显著诱导表达,在干旱和盐胁迫处理0、...
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关 键 词: | 甘薯 转录因子 IbGATA16 非生物胁迫 表达模式 |
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