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甘薯IbGATA16基因的克隆与表达分析
引用本文:王崇,王连军,雷剑,靳晓杰,柴沙沙,邹语嫣,杨新笋,程贤亮,焦春海,田小海.甘薯IbGATA16基因的克隆与表达分析[J].热带作物学报,2023(12):2477-2484.
作者姓名:王崇  王连军  雷剑  靳晓杰  柴沙沙  邹语嫣  杨新笋  程贤亮  焦春海  田小海
作者单位:1. 长江大学农学院;2. 湖北省农业科学院粮食作物研究所
基金项目:国家重点研发计划项目(No.2019YFD1001305);;国家现代甘薯产业技术体系建设项目(No.CARS-10);
摘    要:GATA类转录因子在调控植物响应非生物胁迫中发挥重要作用。本研究从甘薯中克隆出1个IbGATA16基因,对其进行生物信息学分析,并对IbGATA16基因在甘薯干旱和盐胁迫处理中的表达模式进行分析。结果表明:甘薯IbGATA16基因CDS序列全长420bp,编码139个氨基酸,蛋白分子量为15.39kDa,等电点为9.97;IbGATA16基因组全长为582 bp,包含3个外显子和2个内含子;IbGATA16为不稳定的亲水性脂溶蛋白,亚细胞定位预测显示该蛋白定位于细胞核,具有C-X2-C-X17-C-X2-C结构域,属于典型的GATA类转录因子。IbGATA16基因上游1382bp的启动子序列存在多种顺式作用元件,如MYB、ABRE、GARE-motif等。多重序列比对和系统进化树分析结果显示,IbGATA16蛋白与三裂叶薯ItGATA16的亲缘关系最近,N端的锌指结构域序列高度一致,表明二者可能具有相似的功能。实时荧光定量结果表明,IbGATA16在甘薯根、茎、叶片等组织中均有表达,在叶中的表达量显著高于茎与根的表达量。IbGATA16对干旱和盐胁迫显著诱导表达,在干旱和盐胁迫处理0、...

关 键 词:甘薯  转录因子  IbGATA16  非生物胁迫  表达模式
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