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木薯MNP标记在品种鉴定中的应用
引用本文:万人静,李琼,周新成,李论,李甜甜,周俊飞,李莎,彭海,章伟雄,方治伟.木薯MNP标记在品种鉴定中的应用[J].热带作物学报,2023(12):2417-2423.
作者姓名:万人静  李琼  周新成  李论  李甜甜  周俊飞  李莎  彭海  章伟雄  方治伟
作者单位:1. 江汉大学生命科学学院;2. 江汉大学系统生物学研究院;3. 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所;4. 中国热带农业科学院热带生物技术研究所;5. 三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室;6. 中国长江三峡集团有限公司中华鲟研究所;7. 香港理工大学医疗科技及资讯学系
基金项目:国家重点研发计划项目(No.2018YFD1000505);;三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室开放课题项目(No.2021041—ZHX);
摘    要:MNP(multiple nucleotide polymorphism, MNP)是随着分子标记技术的发展而产生的一种新型分子标记技术。靶向测序基因型技术(genotyping by target sequencing, GBTS)在一个扩增子内仅扩增一个SNP位点,MNP基于GBTS可在一个扩增子内同时扩增多个SNP位点。该技术具有成本低、检测效率高、应用灵活、适应性广等特点,MNP标记可用于育种过程的鉴定。为了建立快速、精准、高效的木薯品种鉴定方法,筛选适用于木薯品种鉴定的MNP分子标记,本研究在全基因组范围内筛选高多态性区域并设计引物,最终在全基因范围内获得623个木薯MNP标记位点,并利用28个木薯品种对木薯MNP标记进行评价。结果表明,MNP标记分型重现性高达100%。MNP标记位点在28个木薯品种中检出(4.07±1.68)种等位基因型,最多具有12种等位基因型。对所有木薯品种进行两两比较时,99.47%(376/378)的品种对间的差异大于46%,比例在0.3%~81.0%之间,均值为71.78%。相较于SNP,MNP具有更好的品种区分能力。综上所述,本研究所开发的木薯...

关 键 词:木薯  分子标记  MNP  品种鉴定
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