木薯MNP标记在品种鉴定中的应用 |
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引用本文: | 万人静,李琼,周新成,李论,李甜甜,周俊飞,李莎,彭海,章伟雄,方治伟.木薯MNP标记在品种鉴定中的应用[J].热带作物学报,2023(12):2417-2423. |
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作者姓名: | 万人静 李琼 周新成 李论 李甜甜 周俊飞 李莎 彭海 章伟雄 方治伟 |
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作者单位: | 1. 江汉大学生命科学学院;2. 江汉大学系统生物学研究院;3. 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所;4. 中国热带农业科学院热带生物技术研究所;5. 三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室;6. 中国长江三峡集团有限公司中华鲟研究所;7. 香港理工大学医疗科技及资讯学系 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(No.2018YFD1000505);;三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室开放课题项目(No.2021041—ZHX); |
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摘 要: | MNP(multiple nucleotide polymorphism, MNP)是随着分子标记技术的发展而产生的一种新型分子标记技术。靶向测序基因型技术(genotyping by target sequencing, GBTS)在一个扩增子内仅扩增一个SNP位点,MNP基于GBTS可在一个扩增子内同时扩增多个SNP位点。该技术具有成本低、检测效率高、应用灵活、适应性广等特点,MNP标记可用于育种过程的鉴定。为了建立快速、精准、高效的木薯品种鉴定方法,筛选适用于木薯品种鉴定的MNP分子标记,本研究在全基因组范围内筛选高多态性区域并设计引物,最终在全基因范围内获得623个木薯MNP标记位点,并利用28个木薯品种对木薯MNP标记进行评价。结果表明,MNP标记分型重现性高达100%。MNP标记位点在28个木薯品种中检出(4.07±1.68)种等位基因型,最多具有12种等位基因型。对所有木薯品种进行两两比较时,99.47%(376/378)的品种对间的差异大于46%,比例在0.3%~81.0%之间,均值为71.78%。相较于SNP,MNP具有更好的品种区分能力。综上所述,本研究所开发的木薯...
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关 键 词: | 木薯 分子标记 MNP 品种鉴定 |
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