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基于SLAF-seq技术的山西省地方梨品种的SNP分析
引用本文:白牡丹,郝国伟,张晓伟,杨 盛,郭黄萍.基于SLAF-seq技术的山西省地方梨品种的SNP分析[J].西北农业学报,2020,30(7):1020-1027.
作者姓名:白牡丹  郝国伟  张晓伟  杨 盛  郭黄萍
作者单位:(山西省农业科学院 果树研究所/果树种质创制与利用山西省重点实验室,太原 030031)
基金项目:国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-28-28),山西省农业科学院生物育种工程项目(17yzgc036),山西省农业科学院应用基础研究计划项目(YCX2020YQ09)。
摘    要:利用简化基因组测序技术 SLAF-seq 测序对30个山西省地方梨品种群体结构与亲缘关系进行分析,旨在为梨育种及其资源利用提供参考。通过序列分析,获得603 177个SLAF标签,其中多态性的SLAF标签302 703个,共得到2 140 079个群体SNP。利用这些SNP标签分析可得30个梨品种可以分为两大类。通过构建进化树发现,‘金梨’与‘大黄梨’虽田间性状比较相似,但在进化树上显示两者亲缘关系较远,可以断定二者为不同梨品种。

关 键 词:  SLAF-seq  SNP  群体结构  进化树

SNP Analysis of Local Pear Germplasm Resources in Shanxi Province Based on SLAF seq Technology
BAI Mudan,HAO Guowei,ZHANG Xiaowei,YANG Sheng and GUO Huangping.SNP Analysis of Local Pear Germplasm Resources in Shanxi Province Based on SLAF seq Technology[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2020,30(7):1020-1027.
Authors:BAI Mudan  HAO Guowei  ZHANG Xiaowei  YANG Sheng and GUO Huangping
Abstract:
Keywords:Pear  SLAF-seq  SNP  Population structure  Phylogenetic tree
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