| 基于转录组学筛选miR-125b-2敲除小鼠睾丸发育相关基因及信号通路的研究 |
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| 引用本文： | 李龙龙,朱燕玲,曾斌,何家建,孙加节,陈婷,罗君谊,张永亮,习欠云.基于转录组学筛选miR-125b-2敲除小鼠睾丸发育相关基因及信号通路的研究[J].畜牧兽医学报,2019(10). |
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| 作者姓名： | 李龙龙 朱燕玲 曾斌 何家建 孙加节 陈婷 罗君谊 张永亮 习欠云 |
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| 作者单位： | 华南农业大学动物科学学院国家生猪种业工程技术研究中心广东省动物营养调控重点实验室 |
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| 摘 要： | 旨在研究miR-125b-2对动物精子发生和成熟的调节作用,挖掘与miR-125b-2有密切靶向关系的功能基因及信号通路。本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,构建了miR-125b-2基因敲除小鼠模型。将3只野生型(WT)小鼠和3只miR-125b-2敲除型(KO)小鼠睾丸的总RNA样分别制成样品池,采用Illumina HiSeq~(TM)4000平台进行转录组测序(RNA-seq),将组装得到的Unigene序列注释到Nr和KEGG数据库中注释,并进行睾丸差异表达基因(DEGs)聚类分析。结果显示,在WT和KO组睾丸组织中共筛选出324个DEGs,其中被GO注释的180个DEGs显著富集到80个包括精子染色质缩合在内的生物学过程,22个含有线粒体内膜预序列转位酶复合物在内的细胞组成以及41个包括核糖体结构组成在内的分子功能。同时KEGG分析显示,所有被注释的DEGs显著富集到74条信号通路,其中排前3位极显著的信号通路依次为:RNA转运、信使RNA监视通路和合硒化合物新陈代谢。综上表明,敲除miR-125b-2主要影响睾丸中与精子染色质结构和线粒体功能相关基因的表达,其中与精子发生相关的3个基因Papolb、Tssk1和Slc22a14表达均显著上调。结果为进一步研究miR-125b-2对精子生成的功能调节提供基础。
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