| 基于测序技术的海南地方猪TLR2基因多态性分析 |
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| 引用本文： | 张艳,刘海隆,王文秀,黄丽丽.基于测序技术的海南地方猪TLR2基因多态性分析[J].畜牧与兽医,2019(7):46-50. |
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| 作者姓名： | 张艳 刘海隆 王文秀 黄丽丽 |
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| 作者单位： | 海南省农业科学院畜牧兽医研究所;海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室;山东省滨州畜牧兽医研究院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金地区科学基金项目(31560696);海南省自然科学基金创新研究团队项目(2018CXTD345);海南省农业科学院农业科技创新专项(CXZX201504) |
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| 摘 要： | 为了解海南地方猪TLR2基因的多态性,本研究采用PCR法从五指山猪、临高猪和屯昌猪3种海南地方猪的血液中克隆Toll样受体2(TLR2)基因,并进行测序及序列分析。结果显示,3种海南地方猪TLR2基因的扩增长度均为2649bp,编码区长2358bp。3种猪TLR2基因序列的种内比对结果显示,五指山猪种内有7个核苷酸位点存在多态性,2处位于编码区;屯昌猪种内有5个核苷酸位点存在多态性,均在编码区外;临高猪种内有4个核苷酸位点存在多态性,1处位于编码区。种间比对结果显示3种猪有12个核苷酸位点存在多态性,其中3处为错义突变,导致氨基酸改变。同源性分析结果显示,3种猪的TLR2基因序列高度保守,同源性在99.6%~99.9%之间。蛋白质结构预测分析显示,海南猪TLR2基因在876、1454位点呈现的AG突变均引起了其蛋白质二级结构和三级结构的改变,提示可能存在TLR2功能的变化。本研究填补了海南地方猪TLR2基因多态性空白,为深入研究TLR2基因多态性与猪疫病易感性的关系提供基础研究资料。
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| 关 键 词： | 海南地方猪 TLR2 基因多态性 基因测序 |
Polymorphic analysis of the TLR2 gene in native Hainan pig breeds based on sequencing technology |
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| ZHANG Yan,LIU Hailong,WANG Wenxiu,HUANG Lili.Polymorphic analysis of the TLR2 gene in native Hainan pig breeds based on sequencing technology[J].Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2019(7):46-50. |
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| Authors: | ZHANG Yan LIU Hailong WANG Wenxiu HUANG Lili |
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| Institution: | (Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine,Hainan Academy of Agricultural Sciences,Haikou 571100,China;Key Laboratoiy of Tropical Animal Breeding and Disease Research,Haikou 571100,China;Shandong Binzhou Institute of Animal Science & Veterinary Medicine,Binzhou 256600,China) |
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| Abstract: | ZHANG Yan;LIU Hailong;WANG Wenxiu;HUANG Lili(Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine,Hainan Academy of Agricultural Sciences,Haikou 571100,China;Key Laboratoiy of Tropical Animal Breeding and Disease Research,Haikou 571100,China;Shandong Binzhou Institute of Animal Science & Veterinary Medicine,Binzhou 256600,China) |
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| Keywords: | native Hainan pig TLR2 gene cloning gene sequencing |
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