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新鲜、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化模式初探
引用本文:赵亚涵,郝海生,杜卫华,庞云渭,闫长亮,刘岩,赵善江,赵学明,朱化彬.新鲜、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化模式初探[J].畜牧兽医学报,2019(6):1179-1188.
作者姓名:赵亚涵  郝海生  杜卫华  庞云渭  闫长亮  刘岩  赵善江  赵学明  朱化彬
作者单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所家畜胚胎工程与繁殖创新团队;中国牧工商(集团)总公司
基金项目:国家自然科学基金面上项目(31472100);中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS06);中国农业科学院“科研英才培育工程”
摘    要:旨在初步分析新鲜及玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化模式。本研究采用单细胞全基因组甲基化测序技术(scWGMS)检测新鲜、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化水平和差异甲基化区域(DMR),探讨两者之间DNA甲基化水平上的差异。结果表明,新鲜卵母细胞体外受精囊胚的整体甲基化水平显著高于玻璃化冷冻卵母细胞体外受精囊胚的整体甲基化水平(P<0.05)。采用基因本体分析(GO)和相关信号通路(KEGG)对143个DMRs分析,发现生物学过程主要显著富集在新陈代谢、生长发育、细胞定位、细胞刺激反应等,通路主要富集在生长发育、核酸结合及组蛋白乙酰化上,并筛选出几个与之相关的候选基因(FARP2、PI4KA、FAM3D、NCOR2、ZNF827等)。本研究初步发现,玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚的全基因组甲基化水平显著降低,且DMR区域主要集中在ATP结合、生长发育及组蛋白乙酰化,为提高玻璃化冷冻卵母细胞体外受精囊胚质量提供信息参考。

关 键 词:玻璃化冷冻  囊胚  全基因组  甲基化  差异甲基化区域

Study on Whole Genome Methylation Pattern of in vitro Fertilized Blastocysts from Fresh and Vitrified Bovine Oocytes
ZHAO Yahan,HAO Haisheng,DU Weihua,PANG Yunwei,YAN Changliang,LIU Yan,ZHAO Shanjiang,ZHAO Xueming,ZHU Huabin.Study on Whole Genome Methylation Pattern of in vitro Fertilized Blastocysts from Fresh and Vitrified Bovine Oocytes[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2019(6):1179-1188.
Authors:ZHAO Yahan  HAO Haisheng  DU Weihua  PANG Yunwei  YAN Changliang  LIU Yan  ZHAO Shanjiang  ZHAO Xueming  ZHU Huabin
Institution:(Embryo Biotechnology and Reproduction Laboratory,Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100193,China;China Animal Husbandry Group(CAHG),Beijing 100070,China)
Abstract:ZHAO Yahan;HAO Haisheng;DU Weihua;PANG Yunwei;YAN Changliang;LIU Yan;ZHAO Shanjiang;ZHAO Xueming;ZHU Huabin(Embryo Biotechnology and Reproduction Laboratory,Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100193,China;China Animal Husbandry Group(CAHG),Beijing 100070,China)
Keywords:vitrification  blastocyst  whole genome  methylation  differential methylation region
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