| 山羊DCT基因启动子区甲基化水平、SNP与毛色特征关系研究 |
| |
| 引用本文： | 杜小龙,王麒,张乐超,葛琳涵,刘小辉,王涵,李兰会,李祥龙.山羊DCT基因启动子区甲基化水平、SNP与毛色特征关系研究[J].畜牧兽医学报,2019(2):271-279. |
| |
| 作者姓名： | 杜小龙 王麒 张乐超 葛琳涵 刘小辉 王涵 李兰会 李祥龙 |
| |
| 作者单位： | 河北农业大学动物科技学院;河北省牛羊胚胎工程技术研究中心;河北科技师范学院 |
| |
| 基金项目： | 河北省应用基础研究计划重点基础研究项目(15962901d);河北省自然科学基金项目(C2015204176) |
| |
| 摘 要： | 旨在探究DCT基因启动子区甲基化水平和SNP突变对山羊毛色的影响,为探索DCT基因调控山羊毛色变化的机理提供理论依据。本研究以山羊为试验动物,对DCT基因启动子区进行CpG岛预测,设计引物对预测的2个CpG岛富集区域进行亚硫酸氢盐甲基化测序,使用甲基化水平分析软件BISMA统计甲基化位点,比较唐山奶山羊(白色)和南江黄羊(黑色品系)两种不同毛色山羊群体DCT基因启动子区甲基化水平差异。克隆DCT基因核心启动子区,筛选不同毛色山羊群体的SNPs,使用JASPAR和Nsite预测SNPs位点突变前后转录因子的改变,并检测比较突变前后DCT基因启动子活性变化。结果,成功克隆了山羊DCT基因启动子区甲基化序列及核心启动子区(g.-1045～-318)。在g.-348～-150区域和g.+222～+502区域分别发现6个和23个甲基化位点,其中g.+312、g.+352和g.+400位点与g.+389和g.+404位点白色山羊甲基化水平分别显著和极显著高于黑色山羊(P<0.05和P<0.01),并且g.+222～+502区域白色山羊甲基化平均水平极显著高于黑色山羊(P<0.01)。在DCT基因核心启动子区的g.-804T> G、g.-705C> T和g.-679G> A,3个SNPs位点的基因型构成在白色山羊和3个有色山羊群体中存在差异,g.-804T> G突变导致该区域的SOX10转录因子结合位点缺失,DCT基因启动子活性显著下降(P<0.05)。结果显示,白色山羊DCT基因g.+222～+502区域的高甲基化水平,g.-804、g.-714和g.-679 3个位点的突变,尤其是g.-804T> G造成SOX10转录因子结合位点的缺失,突变的G型DCT基因启动子活性显著降低。因此,DCT基因启动子区SNP突变和高甲基化水平可能抑制了基因的表达从而形成山羊白色被毛。
|
| 关 键 词： | 山羊毛色 DCT基因 启动子区 甲基化 SNP |
Study on the Relationship between Methylation Level,SNP in Promoter Region of DCT Gene and Hair Color in Goat |
| |
| DU Xiaolong,WANG Qi,ZHANG Lechao,GE Linhan,LIU Xiaohui,WANG Han,LI Lanhui,LI Xianglong.Study on the Relationship between Methylation Level,SNP in Promoter Region of DCT Gene and Hair Color in Goat[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2019(2):271-279. |
| |
| Authors: | DU Xiaolong WANG Qi ZHANG Lechao GE Linhan LIU Xiaohui WANG Han LI Lanhui LI Xianglong |
| |
| Institution: | (College of Animal Science and Technology,Hebei Agricultural University,Baoding 071000,China;Hebei Normal University of Science & Technology,Qinhuangdao 066004,China;Research Center of Cattle and Sheep Embryo Engineering Technique of Hebei,Baoding 071000,China) |
| |
| Abstract: | DU Xiaolong;WANG Qi;ZHANG Lechao;GE Linhan;LIU Xiaohui;WANG Han;LI Lanhui;LI Xianglong(College of Animal Science and Technology,Hebei Agricultural University,Baoding 071000,China;Hebei Normal University of Science & Technology,Qinhuangdao 066004,China;Research Center of Cattle and Sheep Embryo Engineering Technique of Hebei,Baoding 071000,China) |
| |
| Keywords: | goat coat color DCT gene promoter region methylation SNP |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
|
