| 犏牛雄性不育相关lncRNA的鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 阿果约达,熊显荣,王艳,杨显英,韩杰,王斌,李键.犏牛雄性不育相关lncRNA的鉴定与分析[J].畜牧兽医学报,2019(3):551-561. |
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| 作者姓名： | 阿果约达 熊显荣 王艳 杨显英 韩杰 王斌 李键 |
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| 作者单位： | 西南民族大学生命科学与技术学院青藏高原动物遗传资源保护与利用国家教育部重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发专项(2018YFD0502304);四川省科技支撑计划(2017NZ0076);牦牛遗传资源保护利用创新团队(13CXTD01);西南民族大学研究生创新型科研项目(CX2018SZ07) |
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| 摘 要： | 旨在分析成年健康牦牛和犏牛(3～4岁)睾丸组织中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达谱,从而探究lncRNA与犏牛雄性不育机制的关联性,为解释犏牛雄性不育的机理提供理论依据。采集成年(3～4岁)健康牦牛、犏牛各3头的睾丸组织,构建cDNA文库后进行高通量测序,筛选出差异的lncRNA,通过对差异显著的lncRNA与mRNA位置关系以及结合能的判定预测顺式作用(cis)和反式作用(tran)的靶基因,并进行GO、KEGG功能分析。结果表明,共得到牦牛和犏牛候选lncRNA转录本分别为20 363和24 133个,两个文库筛选出6 178个显著差异lncRNA,其中有2 470个在犏牛睾丸组织与牦牛比较上调,3 708个下调。筛选得到差异显著lncRNA的候选靶基因2 676个,这些基因参与58个功能分类,共涉及306条通路;其中主要富集的通路包括轴突指导、内吞、Hedgehog等信号通路。综上表明,部分lncRNA介导的靶基因PTGDS、IGF2、MEST、GLIS3、NOTCH2、HOXA10、HOXA11与犏牛雄性不育相关,lncRNA在犏牛的生殖发育中对其雄性不育具有重要的调控作用。利用RNA-Seq技术筛选出成年牦牛和犏牛睾丸组织lncRNA,并进行差异分析,为探讨犏牛雄性不育的机制提供更完善的转录组数据。
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| 关 键 词： | 牦牛 犏牛 雄性不育 转录组 lncRNA |
Identification and Analysis of Long Non-coding RNA Associated with Cattle-yak Male Infertility |
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| A GUO Yueda,XIONG Xianrong,WANG Yan,YANG Xianying,HAN Jie,WANG Bin,LI Jian.Identification and Analysis of Long Non-coding RNA Associated with Cattle-yak Male Infertility[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2019(3):551-561. |
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| Authors: | A GUO Yueda XIONG Xianrong WANG Yan YANG Xianying HAN Jie WANG Bin LI Jian |
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| Institution: | (Key Laboratory of Qinghai-Tibetan Plateau Animal Genetic Resource Reservation andExploitation of Ministry of Education,College of Life Science and Technology,Southwest Minzu University,Chengdu 610041,China) |
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| Abstract: | A GUO Yueda;XIONG Xianrong;WANG Yan;YANG Xianying;HAN Jie;WANG Bin;LI Jian(Key Laboratory of Qinghai-Tibetan Plateau Animal Genetic Resource Reservation andExploitation of Ministry of Education,College of Life Science and Technology,Southwest Minzu University,Chengdu 610041,China) |
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| Keywords: | yak cattle-yak male infertility RNA-seq lncRNA |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
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