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梨S基因检测芯片的oligo探针设计
引用本文:江南,谭晓风.梨S基因检测芯片的oligo探针设计[J].经济林研究,2012,30(3):1-5,36.
作者姓名:江南  谭晓风
作者单位:1. 湖南工业大学绿色包装与生物纳米技术应用湖南省重点实验室,湖南株洲412008;中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙410004
2. 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙,410004
基金项目:国家自然科学基金面上项目,湖南省自然科学基金项目
摘    要:为给梨品种S基因芯片的制备及梨品种自交不亲和性S-RNase基因和S基因型的检测奠定基础,结合已有的对梨自交不亲和S-RNase基因的研究成果及Genbank中梨S-RNase基因信息,利用生物学比对软件Genedoce对梨S-RNase等位基因序列进行比对,得到等位基因HV区的特异序列;用oligo6.71、Premier Premier 5.0和Clustal.W等生物学软件设计特异性高、解链温度Tm值接近、长度均一的oligo探针,获得了24条32 mer的oligo探针。

关 键 词:  自交不亲和性  S-RNase  oligo探针

Design of oligo nucleotide probes on detection genechip of pear S-RNase
JIANG Nan , TAN Xiao-feng.Design of oligo nucleotide probes on detection genechip of pear S-RNase[J].Economic Forest Researches,2012,30(3):1-5,36.
Authors:JIANG Nan  TAN Xiao-feng
Institution:1.Key Laboratory of Green Packaging and Biological Nanotechnology,Hunan University of Technology,Zhuzhou 412008,Hunan,China;2.The Key Lab.of Non-wood Forest Product of Forestry Ministry,Central South University of Forestry & technology,Changsha 410004,Hunan,China)
Abstract:
Keywords:
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