| 柿EST-SSR引物的开发及筛选 |
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| 引用本文： | 吴硕,傅建敏,乌云塔娜,梁玉琴,李芳东.柿EST-SSR引物的开发及筛选[J].经济林研究,2012,30(3):27-31. |
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| 作者姓名： | 吴硕 傅建敏 乌云塔娜 梁玉琴 李芳东 |
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| 作者单位： | 1. 中国林业科学研究院经济林研究开发中心,河南郑州,450003
2. 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙,410004 |
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| 基金项目： | 林业公益性行业科研专项项目"柿属植物种质资源保护与选育技术研究" |
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| 摘 要： | 为丰富柿树SSR引物来源,利用从NCBI下载的9 474条柿属EST序列开发柿EST-SSR引物,并用于分析7个柿品种的遗传多样性。EST序列经去除低质量及冗余片段后拼接成1 390条重叠序列和4 097条无重复序列。共搜索到601条EST序列中含有540个SSR。SSR出现频率为10.96%,其中以2核苷酸为主(61.06%)。利用检出的SSR-ESTs序列设计SSR引物100对,对7个柿样品进行了PCR扩增,31对引物有扩增带,占设计引物的31%,其中14对引物有多态性,占可扩增引物的45.2%。同时发现引物68是临潼板柿的特异引物。引物68的P68-115、P68-160和P68-210处为临潼板柿的3个特异性标记位点,而引物28的P28-225是麻城秋艳的特异性标记位点。
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| 关 键 词： | 柿 EST SSR标记 |
Development and screening of EST-SSR markers in Diospyros kaki Thunb |
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| WU Shuo
,
FU Jian-min
,
WU YUN Ta-na
,
LIANG Yu-qin
,
LI Fang-dong.Development and screening of EST-SSR markers in Diospyros kaki Thunb[J].Economic Forest Researches,2012,30(3):27-31. |
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| Authors: | WU Shuo FU Jian-min WU YUN Ta-na LIANG Yu-qin LI Fang-dong |
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| Institution: | 1(1.Non-timber Forest Research and Development Center,Chinese Academy of Forestry,Zhengzhou 450003,Henan,China;2.The Key Lab of Non-wood Forest Product of Forestry Ministry,Central South University of Forestry & Technology,Changsha 410004,Hunan,China) |
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| Abstract: | |
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