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芒果 CCR 基因的克隆及其序列分析
引用本文:张宇,张波,赵志常,高爱平,陈业渊,黄建峰,党志国,罗睿雄.芒果 CCR 基因的克隆及其序列分析[J].华北农学报,2014(Z1).
作者姓名:张宇  张波  赵志常  高爱平  陈业渊  黄建峰  党志国  罗睿雄
作者单位:1. 海南大学 应用科技学院,海南 儋州,571737
2. 中国热带农业科学院 热带作物品种资源研究所,农业部华南作物基因资源与种质创制重点开发实验室,海南 儋州 571737; 海南大学 农学院,海南 海口 570228
3. 中国热带农业科学院 热带作物品种资源研究所,农业部华南作物基因资源与种质创制重点开发实验室,海南 儋州 571737
基金项目:农业部非营利性科研机构改革启动经费
摘    要:为了研究芒果CCR基因在芒果对芒果树抗性的功能。采用传统的RT-PCR和RACE方法从芒果的枝梢中克隆得到了1个参与木质素生物合成的肉桂酰辅酶-A还原酶基因( CCR)的全长cDNA序列,进而对得到的序列采用TMHMM、DNAMAN等软件进行生物信息学分析,发现芒果CCR基因包含编码区、3′和5′非翻译区的长度为1292 bp的cDNA序列,编码305个氨基酸;对跨膜结构域进行了预测,发现该基因无跨膜结构域;蛋白二级结构元件以无规则卷曲和β-螺旋为主;聚类分析发现,该基因与美洲山杨木、油茶等植物的亲缘关系较近,而与百合、橡胶树等亲缘关系较远。从芒果中克隆得到了一个CCR基因,并对其生物信息学进行了分析,为后续转基因工作打下了基础。

关 键 词:芒果  肉桂酰辅酶A还原酶  基因克隆  序列分析

Cloning and Sequence Analysis of CCR Gene from Mango
ZHANG Yu,ZHANG Bo,ZHAO Zhi-chang,GAO Ai-ping,CHEN Ye-yuan,HUANG Jian-feng,DANG Zhi-guo,LUO Rui-xiong.Cloning and Sequence Analysis of CCR Gene from Mango[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2014(Z1).
Authors:ZHANG Yu  ZHANG Bo  ZHAO Zhi-chang  GAO Ai-ping  CHEN Ye-yuan  HUANG Jian-feng  DANG Zhi-guo  LUO Rui-xiong
Abstract:
Keywords:Mango  Cinnamoyl-CoA reductase ( CCR)  Gene cloning  Sequence analysis
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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