| 水稻NOL(NYC1-like)基因序列多样性、单倍型效应以及表达谱分析 |
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| 引用本文： | 孟祥州,严菊,邢宏堃,王功伟.水稻NOL(NYC1-like)基因序列多样性、单倍型效应以及表达谱分析[J].分子植物育种,2015(3):491-496. |
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| 作者姓名： | 孟祥州 严菊 邢宏堃 王功伟 |
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| 作者单位： | 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 转基因专项(2013ZX08009-001);中央高校基本科研业务费专项资金(2013PY132)共同资助 |
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| 摘 要： | NOL(NYC1-like)基因编码的蛋白在体外试验中显示出Chlb还原酶活性,但是该基因序列变异是如何影响水稻持绿表型的目前还没有报道。本研究利用本实验室的533份已测序的核心种质材料,对该基因的序列进行了多样性分析,本研究将出现频率5%的SNP用于数据分析。该基因含有7种单倍型,Hap1和Hap4中SNP位点大致相同,Hap2、Hap3、Hap6含有相似的SNP位点。在单倍型效应分析中,考虑了核心种质的群体结构影响因素,将每个亚群的单倍型叶绿素含量进行了t-test。结果发现Ind亚群中hap4与hap3的差异极显著,hap3与hap4不仅在第一个外显子(181 bp)处产生非同义突变,而且还含有大量的启动子区的变异位点,这些位点有待于后期的功能验证。通过本实验室的表达谱数据库显示,在用植物激素处理的3份水稻材料幼苗中的NOL基因表达量非常高,这说明NOL基因与植物激素的调控有关,其次发现在衰老的叶片中表达量比较高,说明在叶片衰老后期NOL基因参与叶绿素的降解。研究结果从RNA水平为NOL基因调控叶绿素降解作用机理奠定了理论基础。
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| 关 键 词： | 单倍型 SNP 叶绿素 NOL基因 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
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