| 中国不同省份籼稻地方品种的遗传结构分析 |
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| 引用本文： | 张媛媛,束爱萍,张立娜,曹桂兰,韩龙植.中国不同省份籼稻地方品种的遗传结构分析[J].作物学报,2011,37(12):2173-2178. |
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| 作者姓名： | 张媛媛 束爱萍 张立娜 曹桂兰 韩龙植 |
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| 作者单位： | 1.中国农业科学院作物科学研究所 / 农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程 / 农业部作物种质资源利用重点开放实验室，北京 100081；2江西省农业科学院水稻研究所，江西南昌330200 |
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| 基金项目： | 农业部农作物种质资源保护项目，国家重点基础研究发展计划(973计划)项目，国家转基因专项生物新品种培育重大专项课题，国家"十一五"科技支撑计划项目 |
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| 摘 要： | 利用78对SSR引物，对原产于中国14个省份的280份籼稻地方品种进行遗传多样性分析。在此基础上，采用Powermarker、Structure2.2和Popgen32三种软件分析其遗传结构。基于Nei’s遗传距离的聚类结果显示，供试材料可分为6个类群，相邻省份的品种基本聚在同一类群中，且在每个类群中各省份籼稻地方品种单独形成一个小类群，说明同一省份内品种的遗传基础较相似。而陕西籼稻地方品种聚在2个类群中，台湾籼稻地方品种聚在3个类群中，这两个省的籼稻地方品种遗传背景较复杂。按Structure 2.2软件分析结果，供试材料可分为4大类群，地理位置较近的省份籼稻地方品种基本聚在同一类群中，而陕西和台湾籼稻地方品种较分散聚于不同类群，与基于Nei’s遗传距离的聚类结果类似。按Popgen 32软件分析结果，供试材料各省份也分为4大类群。除个别省份外，相隔较近的多数省份基本聚在同一小类群或大类群中。3种软件的分析结果虽有一些差异，但基本趋于一致，并互为补充。总体而言，同一个省份的籼稻地方品种基本聚在同一小类群；相隔较近省份的籼稻地方品种多数聚类在同一个类群中，聚类结果与品种所处的地理位置相关。陕西和台湾籼稻地方品种的遗传基础较复杂。
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| 关 键 词： | 籼稻 地方品种 微卫星标记 遗传结构 |
| 收稿时间： | 2011-02-22 |
Analysis of Genetic Structure for Indica Rice Landraces from Different Provinces in China |
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| ZHANG Yuan-Yuan,SHU Ai-Ping,ZHANG Li-Na,CAO Gui-Lan,HAN Long-Zhi.Analysis of Genetic Structure for Indica Rice Landraces from Different Provinces in China[J].Acta Agronomica Sinica,2011,37(12):2173-2178. |
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| Authors: | ZHANG Yuan-Yuan SHU Ai-Ping ZHANG Li-Na CAO Gui-Lan HAN Long-Zhi |
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| Institution: | 1.Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences / National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement / Key Laboratory of Crop Germplasm Resources and Utilization, Ministry of Agriculture, Beijing 100081 China;2.Rice Research Institute, Jiangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanchang 330200, China |
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| Abstract: | Two hundred and eighty indica rice landraces from 14 provinces in China were analyzed using 78 microsatellite markers distributed across the whole rice genome.The genetic structure of these entries was studied using Powermarker,Structure 2.2 and Popgen 32 softwares.Using Powermarker software,all landraces were classified into six groups based on Nei's genetic distance;landraces from adjacent provinces were massed in the same large group,and those of a certain province were clustered together in the same sma... |
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| Keywords: | Indica Landrace SSR marker Genetic structure |
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