| 牦牛SPAG11基因克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 徐绮嫔,王 寒,李计尚,等.牦牛SPAG11基因克隆与生物信息学分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2016,44(12):28-34,44. |
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| 作者姓名： | 徐绮嫔 王 寒 李计尚 等 |
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| 作者单位： | 四川农业大学 动物医学院 奶牛疾病研究中心,四川农业大学 动物医学院 奶牛疾病研究中心,四川农业大学 动物医学院 奶牛疾病研究中心 |
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| 基金项目： | 教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队项目（IRT0848）；国家自然科学基金项目（31172379）；四川农业大学学科建设双支计划项目（3570806） |
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| 摘 要： | 【目的】克隆牦牛(Bos grunniens)精子相关抗原11(Sperm-Associated Antigen 11,SPAG11)基因,并了解其分子结构特征,为进一步研究牦牛SPAG11生物学功能奠定基础。【方法】从牦牛睾丸中提取总RNA,RTPCR扩增并克隆SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E基因,测序后进行生物信息学分析。【结果】克隆出牦牛SPAG11基因3个亚型:SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E,序列大小分别是351,408和261bp,分别编码117,129和80个氨基酸,其中SPAG11 D和SPAG11E序列包含1个完整开放阅读框(ORF),SPAG11C序列包含部分ORF。牦牛SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E核苷酸序列与黄牛(Bos taurus)相应序列相似性最高,而与黄牛β-防御素1相似性较低(50%)。3个蛋白亚型均具有β-防御素家族基本特性,生物信息学分析显示其均含有磷酸化位点。【结论】成功克隆牦牛SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E基因,明确了其编码蛋白的分子结构特征。
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| 关 键 词： | 牦牛 精子相关抗原11 β-防御素 生物信息学 |
| 收稿时间： | 6/7/2015 12:00:00 AM |
Cloning and bioinformatics analysis of SPAG11 gene in yak (Bos grunniens) |
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| XU Qipin,WANG Han and LI Jishang,et al.Cloning and bioinformatics analysis of SPAG11 gene in yak (Bos grunniens)[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2016,44(12):28-34,44. |
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| Authors: | XU Qipin WANG Han and LI Jishang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | yak (Bos grunniens) Sperm-Associated Antigen 11( SPAG11) beta-defesin bioinformatics |
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