| 安徽东流水牛线粒体D-Loop区遗传多样性与系统进化分析 |
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| 引用本文： | 赵拴平,贾玉堂,徐 磊,等.安徽东流水牛线粒体D-Loop区遗传多样性与系统进化分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2016,44(12):21-27. |
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| 作者姓名： | 赵拴平 贾玉堂 徐 磊 等 |
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| 作者单位： | 安徽省农业科学院 畜牧兽医研究所,安徽省农业科学院 畜牧兽医研究所,安徽省农业科学院 畜牧兽医研究所 |
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| 基金项目： | 国家肉牛牦牛产业技术体系项目-合肥综合试验站（CARS-38）；安徽省农业科学院院长青年创新基金项目（14B0428） |
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| 摘 要： | 【目的】分析安徽东流水牛群体的分子遗传特性,为今后开展我国地方水牛品种研究提供科学依据。【方法】采用测序技术测定安徽东至县31头东流水牛线粒体DNA(mtDNA)D-Loop序列,结合GenBank数据库中已报道的22个群体的471条中国水牛D-Loop序列进行联合分析,利用DnaSP 5.1软件统计核苷酸多样性和单倍型多样性,利用MEGA 5.10软件构建N-J系统发生树,利用Network 4.60软件构建单倍型的media-joining网络。【结果】在22个中国水牛群体中发现163个变异位点,180个单倍型,其核苷酸多样性为0.018 23±0.002 21,单倍型多样性为0.877 40±0.013 80,其中在东流水牛D-Loop序列中发现70个变异位点,构成35种单倍型,其核苷酸多样性为0.013 31±0.002 08,单倍型多样性为0.944 00±0.023 00,群体变异性水平与中国其他水牛群体接近。N-J系统发生树和media-joining进化网络显示,中国水牛分为沼泽型和江河型,前者又分为A和B支系,B支系包括b1和b22个亚支系,东流水牛分布于A和B支系中。【结论】东流水牛群体遗传多样性丰富,且线粒体具有2个母系来源。
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| 关 键 词： | 水牛 线粒体DNA 遗传多样性 单倍型 |
| 收稿时间： | 2015/7/22 0:00:00 |
Genetic variation and phylogeny of Dongliu Buffalo based on mitochondrial DNA D-Loop |
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| ZHAO Shuanping,JIA Yutang and XU Lei,et al.Genetic variation and phylogeny of Dongliu Buffalo based on mitochondrial DNA D-Loop[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2016,44(12):21-27. |
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| Authors: | ZHAO Shuanping JIA Yutang and XU Lei |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | buffalo mitochondrial DNA genetic diversity haplotype |
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