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鸭坦布苏病毒荧光定量RT-PCR方法的建立及应用
引用本文:王巧萍,严红亚,李珂,朱鹤然,元正菊,常志顺,张以芳,信爱国.鸭坦布苏病毒荧光定量RT-PCR方法的建立及应用[J].中国动物检疫,2021,38(11):124-130.
作者姓名:王巧萍  严红亚  李珂  朱鹤然  元正菊  常志顺  张以芳  信爱国
基金项目:国家现代农业产业技术(水禽)体系资助项目(CARS-42);云南省廖明专家工作站(202105AF150077);云南省重大科技专项(202102AE090029)
摘    要:为建立鸭坦布苏病毒(duck tembusu virus,DTMUV)荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)检测方法,对DTMUV的NS5基因设计特异性引物和MGB探针,使用RT-PCR扩增NS5基因并将其连接到pEASY?-T1载体上构建重组质粒,提取阳性重组质粒作为qRT-PCR阳性模板绘制标准曲线,用SYBR Green I法检测MGB探针法qRT-PCR的引物是否有非特异性扩增,并进行特异性、敏感性、重复性试验和临床样品检测。结果显示:MGB探针法qRT-PCR标准曲线的相关系数为0.999 3,其引物没有非特异性扩增;对于其他阳性样本,如鸭肝炎病毒(DHV)、新城疫病毒(NDV)、禽流感病毒(AIV)等抗原无扩增曲线,只能检出DTMUV;qRT-PCR敏感性可达3×102 copies/μL,是普通RT-PCR的10 000倍;批内和批间重复性试验变异系数(CV)为0.08%~0.49%,均小于0.5%。从云南省不同地区采集20份临床出现产蛋下降症状的病鸭组织,应用试验建立的qRT-PCR方法检出12份阳性样品,而普通RT-PCR检出10份,两者的阳性率分别为60%(12/20)和50%(10/20)。结果表明,本试验成功建立了基于DTMUV NS5基因的MGB探针qRT-PCR检测方法,其标准曲线线性关系显著,特异性强,与其他禽源性病原无交叉反应性,敏感性和重复性良好,敏感性和阳性检出率较普通RT-PCR高,更适合于DTMUV感染的临床诊断和流行病学调查。

关 键 词:鸭坦布苏病毒  NS5基因  荧光定量RT-PCR  MGB探针

Establishment and Application of a Fluorescence Quantitative RT-PCR Assay for Duck Tembusu Virus
Wang Qiaoping,Yan Hongy,Li Ke,Zhu Heran,Yuan Zhengju,Chang Zhishun,Zhang Yifang,Xin Aiguo.Establishment and Application of a Fluorescence Quantitative RT-PCR Assay for Duck Tembusu Virus[J].China Journal Of Animal Quarantine,2021,38(11):124-130.
Authors:Wang Qiaoping  Yan Hongy  Li Ke  Zhu Heran  Yuan Zhengju  Chang Zhishun  Zhang Yifang  Xin Aiguo
Abstract:
Keywords:
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